Loading...
HomeMy WebLinkAbout001 ApplicationApr 03 2019 Log Item 1 Page 1 of 204 Log Item 1 Page 2 of 204 Apr 03 2019 Log Item 1 Page 3 of 204 Log Item 1 Page 4 of 204 Apr 03 2019 Log Item 1 Page 5 of 204 Site Plan - BDN LLC Geoduck Farm Apr 03 2019 Log Item 1 Page 6 of 204 Apr 03 2019 Log Item 1 Page 7 of 204 Log Item 1 Page 8 of 204 Log Item 1 Page 9 of 204 Log Item 1 Page 10 of 204 Log Item 1 Page 11 of 204 Log Item 1 Page 12 of 204 Log Item 1 Page 13 of 204 Log Item 1 Page 14 of 204 Log Item 1 Page 15 of 204 Log Item 1 Page 16 of 204 Log Item 1 Page 17 of 204 Log Item 1 Page 18 of 204 Log Item 1 Page 19 of 204 Log Item 1 Page 20 of 204 Log Item 1 Page 21 of 204 Log Item 1 Page 22 of 204 Log Item 1 Page 23 of 204 Log Item 1 Page 24 of 204 Log Item 1 Page 25 of 204 Log Item 1 Page 26 of 204 Log Item 1 Page 27 of 204 Log Item 1 Page 28 of 204 Apr 03 2019 Log Item 1 Page 29 of 204 Log Item 1 Page 30 of 204 Log Item 1 Page 31 of 204 Log Item 1 Page 32 of 204 Log Item 1 Page 33 of 204 Log Item 1 Page 34 of 204 Log Item 1 Page 35 of 204 Log Item 1 Page 36 of 204 Log Item 1 Page 37 of 204 Log Item 1 Page 38 of 204 Log Item 1 Page 39 of 204 Log Item 1 Page 40 of 204 Log Item 1 Page 41 of 204 Log Item 1 Page 42 of 204 Log Item 1 Page 43 of 204 County's Exhibit 4 - Page 028 Apr 03 2019 Log Item 1 Page 44 of 204 County's Exhibit 4 - Page 029 Log Item 1 Page 45 of 204 County's Exhibit 4 - Page 030 Log Item 1 Page 46 of 204 County's Exhibit 4 - Page 031 Log Item 1 Page 47 of 204 County's Exhibit 4 - Page 032 Log Item 1 Page 48 of 204 County's Exhibit 4 - Page 033 Log Item 1 Page 49 of 204 County's Exhibit 4 - Page 034 Log Item 1 Page 50 of 204 County's Exhibit 4 - Page 035 Log Item 1 Page 51 of 204 County's Exhibit 4 - Page 036 Log Item 1 Page 52 of 204 County's Exhibit 4 - Page 037 Log Item 1 Page 53 of 204 County's Exhibit 4 - Page 038 Log Item 1 Page 54 of 204 County's Exhibit 4 - Page 039 Log Item 1 Page 55 of 204 County's Exhibit 4 - Page 040 Log Item 1 Page 56 of 204 County's Exhibit 4 - Page 041 Log Item 1 Page 57 of 204 County's Exhibit 4 - Page 042 Log Item 1 Page 58 of 204 County's Exhibit 4 - Page 043 Log Item 1 Page 59 of 204 County's Exhibit 4 - Page 044 Log Item 1 Page 60 of 204 County's Exhibit 4 - Page 045 Log Item 1 Page 61 of 204 County's Exhibit 4 - Page 046 Log Item 1 Page 62 of 204 County's Exhibit 4 - Page 047 Log Item 1 Page 63 of 204 County's Exhibit 4 - Page 048 Log Item 1 Page 64 of 204 County's Exhibit 4 - Page 049 Log Item 1 Page 65 of 204 County's Exhibit 4 - Page 050 Log Item 1 Page 66 of 204 County's Exhibit 4 - Page 051Log Item 1 Page 67 of 204 County's Exhibit 4 - Page 052Log Item 1 Page 68 of 204 County's Exhibit 4 - Page 053 Log Item 1 Page 69 of 204 County's Exhibit 4 - Page 054 Log Item 1 Page 70 of 204 County's Exhibit 4 - Page 055 Log Item 1 Page 71 of 204 County's Exhibit 4 - Page 056 Log Item 1 Page 72 of 204 County's Exhibit 4 - Page 057 Log Item 1 Page 73 of 204 County's Exhibit 4 - Page 058 Log Item 1 Page 74 of 204 County's Exhibit 4 - Page 059 Log Item 1 Page 75 of 204 County's Exhibit 4 - Page 060 Log Item 1 Page 76 of 204 County's Exhibit 4 - Page 061 Log Item 1 Page 77 of 204 County's Exhibit 4 - Page 062 Log Item 1 Page 78 of 204 County's Exhibit 4 - Page 063 Log Item 1 Page 79 of 204 County's Exhibit 4 - Page 064 Log Item 1 Page 80 of 204 County's Exhibit 4 - Page 065 Log Item 1 Page 81 of 204 County's Exhibit 4 - Page 066 Log Item 1 Page 82 of 204 County's Exhibit 4 - Page 067 Log Item 1 Page 83 of 204 County's Exhibit 4 - Page 068 Log Item 1 Page 84 of 204 County's Exhibit 4 - Page 069 Log Item 1 Page 85 of 204 County's Exhibit 4 - Page 070 Log Item 1 Page 86 of 204 County's Exhibit 4 - Page 071 Log Item 1 Page 87 of 204 County's Exhibit 4 - Page 072 Log Item 1 Page 88 of 204 County's Exhibit 4 - Page 073 Log Item 1 Page 89 of 204 County's Exhibit 4 - Page 074 Log Item 1 Page 90 of 204 County's Exhibit 4 - Page 075 Log Item 1 Page 91 of 204 County's Exhibit 4 - Page 076 Log Item 1 Page 92 of 204     To: Pamela Sanguinetti, U.S. Army Corps of Engineers  cc:  Robert Smith, Plauché & Carr LLP   Brad Nelson, BDN   From:  Grant Novak, Confluence Environmental Company    Date:  September 13, 2016  Re:  Addendum to Biological Evaluation of BDN LLC Smersh Geoduck Aquaculture Project  (NWS‐2013‐1268)    This document is intended to amend the Biological Evaluation (“BE”) provided by Marine Surveys and  Assessments, Inc., dated October 28, 2013. At the request of the Corps, Confluence has performed  additional eelgrass surveys to confirm the location of native eelgrass (Zostera marina) at the  Smersh/Nelson site. This Addendum updates the BE through updating the location of native eelgrass  on the site, revising the location of proposed geoduck planting consistent with the location of the  eelgrass bed and Corps’ eelgrass buffer requirements, and provides additional analysis regarding the  potential for indirect effects to threatened or endangered species listed under the Endangered Species  Act (ESA) due to potential impacts to eelgrass from geoduck culture and harvest activities. This  Addendum is intended to supplement the original analysis in the BE and any descriptions or analysis  not modified herein should be considered to still be valid and accurate.  A. REVISIONS TO PROJECT DESCRIPTION  Based upon the updated eelgrass survey, BDN has revised its proposed planted area as shown on Figure  1.  The revised planted area will consist of approximately 5.15 acres, generally between approximately  +2 ft. MLLW and a 5‐meter (16.4‐ft) buffer of the dense Z. marina bed edge, located between  approximately ‐1 MLLW and ‐2 MLLW.1,2  There are also a couple of minor modifications to BDN’s  proposed operations as compared to what is described in the BE. BDN employees working at the  Smersh parcel will park at public parking areas on Madrona Vista and use property owned by James  1 On a July 21, 2016 site visit, the Corps requested clarification as to whether area netting would be used. As noted in the original BE, “Area netting over the tubes may be installed to prevent tube dislocation during severe weather” (BE, pg. 5) and “Once [mesh] caps have been removed, area netting will be put down to contain tubes, as the growing geoducks will begin to push these out of the sand” (BE, pg. 6). BDN anticipates that area nets may be used for a maximum of four years to protect geoducks from predators and to provide additional protection against tube dislodgement. 2 The tidal elevations described herein are approximate. The planted area, location of the eelgrass bed, and extent of the eelgrass buffer are all described by GPS coordinates that have been provided to the Corps. Appellant Exhibit 45 page 1106 Apr 03 2019 Log Item 1 Page 93 of 204 www.confenv.com page 2 of 7  Smersh located across the street from the project site as a staging area.3  Further, while BDN may use a  skiff in the manner described in Section 4.b.(1) of the BE (pg. 6), most site inspections will be conducted  by walking the beds at low tide.   B. ADDITIONAL EELGRASS SURVEYS  Confluence performed several additional eelgrass surveys on the Smersh parcel. On September 4, 2015,  Confluence used a towed video system with integrated Global Positioning System (GPS) to collect  information about native eelgrass presence/absence. The towed video data were collected in transects  running perpendicular to the beach and spaced about every 45 feet. In addition, a transect that ran  parallel to the shoreline was collected along the anticipated eelgrass bed edge and landward of the  edge. The video system electronically recorded latitude and longitude to aid in the mapping of native  eelgrass locations. A differential GPS (dGPS) with sub‐meter accuracy was used to collect positions at  one second intervals during the towed video surveys. To aid mapping, a proprietary program created by  Confluence was used when reviewing the video to characterize the presence/absence of eelgrass. The  entirety of the field‐collected video data was reviewed in the office on a high definition monitor to  ensure that habitat variables were accurately characterized. Tabular data describing the vegetative  cover, substrate material, relief, and complexity were then joined, using a time stamp, to the dGPS  positions thereby allowing the high quality characterization of video in the office to be linked to the  dGPS positions and video data collected in the field.    During the September 29, 2015 survey, the edge of native eelgrass was confirmed using snorkel‐based  surveys and a dGPS unit at the Smersh site. Two biologists snorkeled the landward native eelgrass  boundary using a floating dGPS unit to precisely collect location data. The biologists divided the area  into two eelgrass zones: patchy vs. continuous. These zones were mapped according to the following  criteria: (1) Patchy = individual shoots or small patches of native eelgrass (typical of shoots migrating  from the main eelgrass bed), (2) Continuous = the main native eelgrass bed with few locations where  eelgrass was absent (typical of a fringe eelgrass bed). The landward edge of the patchy eelgrass zone  was considered to be the upper (or landward) extent of native eelgrass habitat. Underwater video,  using a GoPro HERO4 camera, was collected during the snorkel‐based surveys. The results from the  September 2015 eelgrass surveys are depicted in Figure 2.  Pursuant to the Corps’ request, Confluence conducted another eelgrass survey on the Smersh parcel on  July 20, 2016 to reconfirm the extent of the eelgrass bed surveyed in 2015. A surveyor walked the Z.  marina bed edge, recording the location using a GPS unit with decimeter accuracy. The location of the  marina bed edge was substantially similar to that mapped by Confluence in 2015 and is depicted in  Figure 1.    3 Depending on the source of geoduck seed, the size of planted seed may be 4-5 mm as opposed to the 10-15 mm seed described in the BE. Appellant Exhibit 45 page 1107 Log Item 1 Page 94 of 204 www.confenv.com page 3 of 7  C. ADDITIONAL ANALYSIS REGARDING EFFECTS TO EELGRASS    Effects to eelgrass have the potential to result in changes to ecosystem functions provided by eelgrass  beds at the Smersh/Nelson site and, thereby, to ESA‐listed species that may benefit from those  services.    1. Location of Eelgrass Beds  Both native eelgrass (Z. marina) and non‐native dwarf eelgrass (Zostera japonica) are present at the  proposed Smersh/Nelson geoduck culture site. Z. marina is abundant at subtidal and lower intertidal  elevations, while Z. japonica is very sparsely distributed at higher intertidal elevations. A bed of dense,  robust Z. marina is located seaward of the extreme low tide elevation (approximately ‐2 ft. mean lower  low water [MLLW]) (Figure 1). Landward of this dense bed edge the beach is substantially composed of  bare sand with occasional patches of sparse Z. japonica. No Z. marina is present landward of  approximately ‐2’ MLLW. Planting of geoducks is planned between approximately +2 ft. MLLW and a 5‐ meter (16.4‐ft) buffer of the dense Z. marina bed edge (Figure 1).    2. Effects to Native Eelgrass from Planting and Maintenance Activities  As mentioned above, the project will incorporate a 5‐meter buffer from the identified Z. marina  eelgrass bed, consistent with the Corps’ conservation measure included in the Programmatic Biological  Assessment concerning Shellfish Activities in Washington State Inland Marine Waters (“PBA”).  The  Biological Opinions submitted by the National Marine Fisheries Service (“NMFS”) and U.S. Fish &  Wildlife Service both confirm that the buffer will adequately protect eelgrass for new shellfish farms.   For example, NMFS found that new farms “will be required to follow the 16‐foot buffer requirements  from native eelgrass, this is not expected to diminish eelgrass density or function of existing eelgrass.”  NMFS, Endangered Species Act (ESA) Section 7(a)(2) Biological Programmatic Opinion and Magnuson‐ Stevens Fishery Conservation and Management Act Essential Fish Habitat Consultation:  Washington  State Commercial Shellfish Aquaculture and Restoration Programmatic (2016), at pg. 72.    3. Impacts to Non‐Native Eelgrass (Z. japonica)  The project may result in the removal of Z. japonica located in the planted area or adverse effects to Z.  japonica from project operations. However, Z. japonica is not a threatened or protected species. To the  contrary, the Washington State Noxious Weed Control Board (NWCB) has classified Z. japonica as a  Class C noxious weed (WAC 16‐750‐015).  Aquatic plants on the noxious weed list are considered “to be  highly destructive, competitive, or difficult to control . . .”  (WAC 16‐750‐001). In adopting the listing,  the NWCB justified the regulation partially based on concerns that Z. japonica can increase the  deposition of silt and detritus. Protecting Z. japonica would be contrary to the State’s designation of the  Appellant Exhibit 45 page 1108 Log Item 1 Page 95 of 204 www.confenv.com page 4 of 7  plant as a Class C noxious weed. Therefore, impacts to Z. japonica existing on the site is considered to  be a less than significant impact.4     4 This amends statements made in the original BE that “Z. japonica will not be removed from the site during planting. Instead, planting will occur through these patches” (BE, pg. 5) and “Still, any activities that reduce harm to Z. japonica, such as planting around the patches, would maintain additional valuable habitat at this site” (BE, pg. 15). While the initial BE notes that Z. japonica creates three-dimensional habitat and complexity as compared to mudflats (pg. 15), as noted above, geoduck aquaculture provides similar three-dimensional complexity through the introduction of tubes and canopy nets. Further, BDN’s operations west of the project site have documented that BDN’s proposed geoduck aquaculture can coexist with Z. japonica. Appellant Exhibit 45 page 1109 Log Item 1 Page 96 of 204 www.confenv.com page 5 of 7  Figure 1. Proposed Geoduck Planting Plan and July 2016 Eelgrass Density ZonesAppellant Exhibit 45 page 1110Log Item 1 Page 97 of 204 www.confenv.com page 6 of 7 Figure 2. Proposed Geoduck Planting Plan and September 2015 Eelgrass Density ZonesAppellant Exhibit 45 page 1111Log Item 1 Page 98 of 204 146 N Canal St, Suite 111  Seattle, WA 98103  www.confenv.com         BDN Inc. SMERSH FARM CUMULATIVE IMPACTS REPORT FINAL REPORT Prepared for: Brad Nelson, BDN Inc. June 2018 Apr 03 2019 Log Item 1 Page 99 of 204 146 N Canal St, Suite 111  Seattle, WA 98103  www.confenv.com   BDN Inc. SMERSH FARM CUMULATIVE IMPACTS REPORT FINAL REPORT Prepared for: BDN Inc. 3011 S. Chandler St. Tacoma, WA 98409 Attn: Brad Nelson Authored by: Confluence Environmental Company June, 2018 Log Item 1 Page 100 of 204 BDN Inc. - SMERSH FARM CUMULATIVE IMPACTS REPORT June 2018 Page i TABLE OF CONTENTS 1.0 INTRODUCTION ................................................................................................................................................... 1  2.0 PROJECT DESCRIPTION .................................................................................................................................... 1  3.0 EFFECTS ANALYSIS ........................................................................................................................................... 2  3.1 Biological Impacts ..................................................................................................................................... 2  3.1.1 Water Quality ............................................................................................................................ 2  3.1.1.1 Filtration .................................................................................................................................... 3  3.1.1.2 Turbidity During Harvest ........................................................................................................... 3  3.1.2 Habitat Functions ...................................................................................................................... 3  3.1.2.1 Sediment Character/Quality ...................................................................................................... 4  3.1.2.2 Sediment Supply and Delivery .................................................................................................. 4   3.1.2.3 Submerged Aquatic Vegetation ................................................................................................ 4  3.2 Impacts to Navigation ............................................................................................................................... 5  3.3 Impacts to Aesthetics ............................................................................................................................... 5  3.4 Impacts to Public Access .......................................................................................................................... 5  4.0 CONCLUSION ...................................................................................................................................................... 6  5.0 REFERENCES ...................................................................................................................................................... 1    TABLES Table 1. Possible impacts due to the proposed project. ................................................................................................. 6    FIGURES Figure 1. Project area and vicinity. ................................................................................................................................. 1                Log Item 1 Page 101 of 204 BDM – Smersh Geoduck Farm Cumulative Impacts Report June 2018 Page 1 1.0 INTRODUCTION BDN, Inc. has leased parcel 721031007 (Smersh parcel) on Shine Road, west of the Hood Canal  Bridge, and is proposing to operate a geoduck farm at the site (Figure 1). A conditional use  permit is required by Jefferson County and, as part of the permit application, a cumulative  impacts assessment has been requested by the County pursuant to Jefferson County Code (JCC)  18.25.440 and JCC 18.25.590.      This report provides an assessment of cumulative impacts that may result from the proposed  project.  Cumulative environmental effects can be defined as environmental effects caused by  the combined results of past, current, and future activities.  This assessment incorporates the  following factors in an assessment and summation of potential cumulative impacts: current  ecological functions, human factors influencing shoreline processes, foreseeable future shoreline  development, beneficial effects of regulatory programs, and conservation measures.  Figure 1. Project area and vicinity. 2.0 PROJECT DESCRIPTION BDN, Inc proposes to plant up to 5.15 acres of geoducks at the site between +2 feet and  approximately ‐2 feet relative to mean lower low water (MLLW). The lower boundary of  planting will be determined based on the location of the eelgrass bed below approximately ‐2  feet MLLW (Confluence 2016).  Log Item 1 Page 102 of 204 BDM – Smersh Geoduck Farm Cumulative Impacts Report June 2018 Page 2 To protect juvenile geoduck until they can burrow deep enough to avoid predators, PVC tubes  4” in diameter by 10” long would be placed into the sandy substrate. Tubes would be placed at  an approximate density of 1 tube per square foot with 3” to 5” of the tube exposed above the  substrate. Area netting may be placed over the tubes to prevent them from becoming dislodged  during severe weather.  Tubes would be removed after 18‐24 months once the geoduck have  reached a sufficient size and depth to avoid predation.  Routine maintenance of the proposed geoduck aquaculture area ensures that gear is preserved  on‐site, and would begin once gear has been installed. Maintenance would occur monthly, and  also immediately following large storm events. Maintenance activities may include monitoring  shellfish weight and health, picking up unnatural debris, ensuring that predator netting is  suitably anchored to the substrate, and ensuring that PVC tubes are not becoming dislodged  from the substrate. Maintenance would typically be done by a two‐person crew over a 4‐hour  period.  Geoduck will be harvested 5‐7 years after planting. Netting may remain on the site until harvest  to protect the crop from theft and/or predation.  3.0 EFFECTS ANALYSIS Potential effects to fish and wildlife habitat, boat navigation, aesthetics, and public access/use  are considered in this assessment. Biological impacts and visual impacts have been assessed in  detail in separate reports (Confluence 2018a, Confluence 2018b). Summaries of the findings of  those assessments are included below in addition to evaluations of effects to boat navigation  and public access.  3.1 Biological Impacts Biological impacts are discussed below as a function of potential effects to water quality (i.e.  filtration by shellfish, turbidity during harvest) and physical habitat functions (i.e. sediment  quality, sediment supply and delivery, submerged aquatic vegetation). Additional detail on  each of these elements is provided in Confluence 2018a.  3.1.1 Water Quality Potential effects to water quality and fish and wildlife species or their habitat are different  during the growing and harvest phases of geoduck aquaculture.  During the growth phase,  geoducks filter phytoplankton and other particles from the water column.  During harvest,  sediment is re‐suspended into the water column.  These two aspects are addressed in further  detail below.  Log Item 1 Page 103 of 204 BDM – Smersh Geoduck Farm Cumulative Impacts Report June 2018 Page 3 3.1.1.1 Filtration The depth at which photosynthetic submerged aquatic vegetation (SAV) can grow is limited by  the depth at which light penetrates through the water column. Shellfish aquaculture can result  in a beneficial reduction in turbidity, and increase in light penetration, due to removal of  phytoplankton and particulate organic matter through filtration. Improvements to water clarity  and light penetration can improve habitat conditions through the growth of SAV.   Shellfish aquaculture or the presence of a naturally dense bivalve community may provide  some control of human nutrient loading to water bodies.  Bivalves remove phytoplankton and  suspended sediment from the water column through filtration, which can have a net benefit to  water quality. When shellfish are harvested, sequestered nutrients are permanently removed  from the system which benefits areas with high nutrient loading, such as Hood Canal.   Shellfish aquaculture infrastructure also provide microhabitats for communities of nitrifying  microbes. Through filtration, sequestration, and hosting of nitrifying microbes commercial  shellfish aquaculture can be considered a net benefit to water quality ecosystem functions.  3.1.1.2 Turbidity During Harvest Geoducks can be harvested when the tide is out or by divers when the tide is in, both methods  use a water jet to loosen the sediment around the geoduck which causes a temporary increase in  suspended sediment and turbidity. A geoduck harvest event is limited geographically and  temporally compared to natural storm events which increase suspended sediment and turbidity  to comparable levels.   Exposure to high levels of suspended sediment can stress fish and result in reduced survival  and growth but studies have shown that fish are likely to avoid localized, elevated turbidity  events such as a geoduck harvest.  Both the timing and intensity of activities are below the natural disturbance regime of typical  Puget Sound storm events and mobile species are able to avoid the harvest area.  Thus, harvest  is not anticipated to result in negative impacts to ecological functions.  3.1.2 Habitat Functions In‐water activities have the potential to alter sediment character/quality, sediment supply and  delivery, or distribution of submerged aquatic vegetation.  Changes to these elements could  result in either negative or beneficial alteration of habitat in the vicinity of the project.  The  potential effects to each of these elements from geoduck culture and harvest is discussed further  below.   Log Item 1 Page 104 of 204 BDM – Smersh Geoduck Farm Cumulative Impacts Report June 2018 Page 4 3.1.2.1 Sediment Character/Quality Sediment along the north shore of Squamish Harbor is primarily sandy in the lower elevations  with gravel and cobble on the upper intertidal beach. No sediment contaminants are known in  the proposed project area and the surrounding land use is low density residential and not  industrial, as is typically associated with sediment contamination.  The proposed project will  not be using any chemicals that may cause sediment contamination.  The proposed project  would not change existing sediment character or quality.   3.1.2.2 Sediment Supply and Delivery The beach slopes gradually and has exposure to wind generated waves from the south, where  winter storms typically come from in Puget Sound. East of the project area there is a high  eroding bluff that supplies sediment to the beach. Net shore‐drift of sediment is to the west,  from the eroding bluff toward the proposed project site.  Shoreline armoring is prevalent along  the north shore of Squamish Harbor, which may generally limit sediment supply in the area.  The two types of potential disturbances associated with shellfish aquaculture that could affect  sediment supply and delivery include the use of tubes and netting that slow the transport of  sediments, and sediment re‐suspension due to harvest activities.  A small accumulation of sediment may collect in the proposed geoduck tubes and is expected to  rapidly redistribute through wave and current action after one or two tidal cycles following the  removal of nets and tubes.  During a geoduck harvest, the overlying sediments are loosened around the clam by a low‐ pressure water hose. Although this activity results in minor, localized changes in elevation and  sediment grain size, both quickly return to baseline conditions within one month after harvest.   In summary, geoduck harvest and the presence of culture tubes and/or cover nets do not lead to  significant impacts to sediment transport or bathymetry. Minor changes in elevation may  persist for up to 1 month, but these effects are insignificant compared to the natural sediment  dynamics along the shoreline associated with the project area.   3.1.2.3 Submerged Aquatic Vegetation A dense bed of eelgrass (Zostera marina) extends from approximately ‐3 ft MLLW, waterward of  the project area to an unknown depth. A narrow band of sparse, patchy eelgrass is landward of  the dense bed between approximately ‐2 and ‐3 feet MLLW. Several sparse patches of non‐ native dwarf eelgrass (Zostera japonica) were observed distributed throughout the proposed  project area.   Macroalgae beds are not found in or near the project area. Green algae (Ulva spp) were present  at a very low density, attached to a small number of hard objects such as derelict clam shells.  Log Item 1 Page 105 of 204 BDM – Smersh Geoduck Farm Cumulative Impacts Report June 2018 Page 5 Macroalgae density is anticipated to increase in the project area due to geoduck farming as the  PVC tubes and cover netting provide solid substrate required by macroalgae for attachment  and growth.   Because the project will be located outside of a 16‐foot protective buffer from native eelgrass, no  negative effects are anticipated to occur to eelgrass due to the proposed project and there may  be an ecological lift from the potential increase in other macroalgal species on the tubes and  netting.  3.2 Impacts to Navigation Geoducks are grown in sediment and infrastructure (netting and tubes) that has very low relief  (less than 5 inches).  This would not result in any impacts to boat navigation.  3.3 Impacts to Aesthetics A visual impacts assessment was completed as part of this project and indicates that visual  impacts due to the project would be very low (Confluence 2018b). The proposed geoduck  planting area covers less than 5 percent of the cone of vision when viewed from nearby  residences. The project is 500 feet wide along the nearly 2‐mile‐long northern shoreline of  Squamish Harbor.  The Smersh site is located on a heavily altered shoreline in a medium‐density, residential  neighborhood. The shoreline has been altered by rip rap hardening, there is a concrete boat  ramp and gravel parking lot on the adjacent public property, riparian trees have been removed  from a number of the adjacent properties to increase private views, and the paved roadway is  adjacent to the shoreline for approximately 1 mile next to the Smersh parcel.    Tides low enough to expose the planting area follow a seasonal pattern in the Puget Sound  region. Larger‐magnitude summer low tides occur during daylight hours, while winter low  tides occur at night. Therefore, geoduck tubes and netting are more visible in summer, and  minimal in winter. Also, geoduck tubes and nets have very low relief and natural macroalgae  colonizes equipment rapidly, quickly resulting in natural color and texture.  Given the site is visible only a small portion of the time, the site is not visible from heavily  traveled routes, the surroundings are heavily altered by local residential development, and the  geoduck tubes and netting will quickly take on a natural color due to colonization by aquatic  flora and fauna, there would be only very low impacts to aesthetics.  3.4 Impacts to Public Access There will be no impacts to beach access as part of this project as the project is located on  private tidelands that are not currently accessible by the public.  Log Item 1 Page 106 of 204 BDM – Smersh Geoduck Farm Cumulative Impacts Report June 2018 Page 6 4.0 CONCLUSION Based on communication with Jefferson County no other like actions are present or proposed in  the area that will cumulatively increase impacts to the area (Bausher 2018).  As presented above,  the proposed project would have minimal negative impact on the local shoreline and some  beneficial impacts.  Past and current use of the area is residential and any impacts to the  shoreline are incorporated into existing background conditions.  Thus, the cumulative impact of  the project on the local ecosystem would range from none to minor as summarized in Table 1.   Table 1. Cumulative Impact Determinations. Impact Category Cumulative Impact Determination Rationale for Impact Determination Biological (Water Quality and Habitat Functions) None  Filtration by geoducks may improve water quality in the vicinity of the proposed project area.  Turbidity will be temporarily increased during harvest, but this will not negatively impact habitat because effects are similar to monthly storm events.  Sediment character and quality will not change as part of the proposed project.  Sediment supply and delivery may be temporarily impacted by accumulating sediment during the proposed project and releasing sediment during harvest.  Submerged aquatic vegetation may be beneficially impacted during the proposed project by increasing the locations where algae can establish. Navigation None  The proposed project has very low relief (e.g., 0.25 feet). Aesthetics Minor  The proposed project will be visible for only short duration during very low tides.  Maintenance will occur monthly to ensure farm is tidy and tubes have not become dislodged.  While not in use, equipment will be stored off-site. Public Access None  Proposed project is located on private tidelands with no public access. Log Item 1 Page 107 of 204 BDM – Smersh Geoduck Farm Cumulative Impacts Report June 2018 Page 1 5.0 REFERENCES Confluence (Confluence Environmental Company). 2016. BDN Eelgrass Delineation –  Final Report. October 31, 2016.  Confluence. 2018a. Smersh Farm Habitat Management Plan and No Net Loss Report. June, 2018.  Confluence. 2018b. Smersh Farm Visual Assessment. June, 2018.  Bausher, A. 2018. Personal communication between Anna Bausher, Jefferson County –  Development Review Division, and Grant Novak, Confluence Environmental. June, 14, 2018 Log Item 1 Page 108 of 204   Log Item 1 Page 109 of 204 146 N Canal St, Suite 111  Seattle, WA 98103  www.confenv.com   To: Anna Bausher, Jefferson County Department of Community Development cc: Rick Mraz, Washington State Department of Ecology; Brad Nelson, BDN Inc. From: Grant Novak, Confluence Environmental Company Date: July 9, 2018 Re: BDN Inc. - Proposed Smersh Geoduck Farm: 2018 Zostera marina bed edge re-verification This memo summarizes the findings of surveys conducted by Confluence Environmental Company  (Confluence) to re‐verify the location of the landward edge of the native eelgrass (Zostera marina)  bed on Jefferson County parcel 721031007 (Smersh parcel). The bed edge was previously surveyed in  2016 by Confluence.  Representatives of the U.S. Corps of Engineers (Matthew Bennett, Pamela  Sanguinetti, and Deborah Schaeffer) visited the Smersh parcel on July 21, 2016 to confirm the  findings of the 2016 eelgrass delineation. The Corps was in agreement with the methods and agreed  that the boundaries of the dense and patchy eelgrass beds were appropriately mapped at that time.  Because more than one year has lapsed since the previous survey was completed, the Washington  State Department of Ecology and Jefferson County have requested that the bed edge be re‐verified to  ensure the proposed geoduck aquaculture project will be sighted at least 16 feet from native eelgrass  so as to reduce the potential for negative impacts to protected resources.   A biologist knowledgeable in Pacific Northwest seagrass identification and survey methods visited  the Smersh parcel during low tide on June 28th between 11:00 am and 1:00 pm. During the time of the  survey, water elevations ranged from ‐0.3 feet to ‐1.6 feet relative to mean lower low water (MLLW).  The surveyor crisscrossed the entirety of the parcel while scanning the substrate to the left and right  in an effort to locate and identify any submerged aquatic vegetation at the site, with a specific focus  on locating native eelgrass.    As with previous surveys, very small, sparse patches of non‐native Japanese eelgrass  (Zostera japonica) were found widely distributed between approximately +2 feet and ‐1 foot MLLW.  No native eelgrass was found above ‐1 foot MLLW. A dense bed of native eelgrass with a patchy  margin was observed below approximately ‐1 to ‐2 feet MLLW. The location of the landward edge of  the native eelgrass bed was accurately recorded using a differential GPS with sub‐meter accuracy.  The 2018 bed edge closely matches the 2016 bed edge in some areas but the patchy margin has  receded waterward in many areas (Figure 1). Nowhere has the bed expanded landward of the 2016  margin.  Thus, the geoduck planting area proposed in 2016, and permitted by the Corps in 2017, will  not be altered in the application for a Jefferson County conditional use permit.   Apr 03 2019 Log Item 1 Page 110 of 204     www.confenv.com page 2 of 2 Figure 1. Comparison of 2016 and 2018 Native Eelgrass Bed Edge. Log Item 1 Page 111 of 204 146 N Canal St, Suite 111  Seattle, WA 98103  www.confenv.com          Smersh Farm Habitat Management Plan and No Net Loss Report - 2018 FINAL REPORT Prepared for: BDN, LLC June 2018 Apr 03 2019 Log Item 1 Page 112 of 204 146 N Canal St, Suite 111  Seattle, WA 98103  www.confenv.com   Smersh Farm Habitat Management Plan and No Net Loss Report - 2018 FINAL REPORT Prepared for: BDN, LLC Attn: Brad Nelson Prepared by: Grant Novak Confluence Environmental Company June 2018 Log Item 1 Page 113 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page i TABLE OF CONTENTS 1.0 INTRODUCTION .............................................................................................................................................. 1  2.0 PROJECT DESCRIPTION................................................................................................................................ 1  2.1 Planting and Grow-Out .................................................................................................................................... 2  2.2 Maintenance .................................................................................................................................................... 4  2.2.1 Site Inspection ........................................................................................................................................ 4  2.2.2 Cap Removal .......................................................................................................................................... 4  2.2.3 Tube and Net Removal ........................................................................................................................... 4  2.3 Harvesting ........................................................................................................................................................ 5  2.4 Habitat Management Plan ............................................................................................................................... 5  2.4.1 Maintenance, Repair, and Operation ...................................................................................................... 5  2.4.2 Species-Specific Activities ...................................................................................................................... 7  2.4.3 Farm Plan Record-Keeping Log ............................................................................................................. 7  3.0 EFFECTS ANALYSIS ...................................................................................................................................... 8  3.1 Noise................................................................................................................................................................ 9  3.1.1 Existing Conditions ................................................................................................................................. 9  3.1.1.1 Airborne Noise ........................................................................................................................................ 9  3.1.1.2 Underwater Noise ................................................................................................................................... 9  3.1.2 Effects of Noise ....................................................................................................................................... 9  3.1.2.1 Effects of Airborne Noise ........................................................................................................................ 9  3.1.2.2 Effects of Underwater Noise ................................................................................................................. 11  3.1.3 Summary of Noise Effects .................................................................................................................... 12  3.2 Water Quality ................................................................................................................................................. 12  3.2.1 Existing Conditions ............................................................................................................................... 12  3.2.2 Effects to Water Quality ........................................................................................................................ 13  3.2.3 Filtration Effects .................................................................................................................................... 13  3.2.4 Harvest Effects ...................................................................................................................................... 14  3.2.5 Summary of Effects to Water Quality .................................................................................................... 16  3.3 Sediment Quality ........................................................................................................................................... 16  3.3.1 Existing Sediment Conditions ............................................................................................................... 16  Log Item 1 Page 114 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page ii 3.3.2 Effects to Sediment Quality ................................................................................................................... 17  3.4 Sediment Transport and Bathymetry ............................................................................................................. 18  3.4.1 Existing Conditions ............................................................................................................................... 18  3.4.2 Effects to Sediment Transport and Bathymetry .................................................................................... 18  3.4.3 Addition of Gear .................................................................................................................................... 18  3.4.4 Harvest Activities .................................................................................................................................. 19  3.4.5 Summary of Effects to Sediment Tranport and Bathymetry .................................................................. 19  3.5 Migration, Access, and Refugia ..................................................................................................................... 19  3.5.1 Existing Conditions ............................................................................................................................... 19  3.5.2 Effects to Migration, Access, and Refugia ............................................................................................ 20  3.6 Forage Fish .................................................................................................................................................... 20  3.6.1 Existing Conditions ............................................................................................................................... 20  3.6.2 Effects to Forage Fish ........................................................................................................................... 21  3.6.3 Spawning Habitat Overlap .................................................................................................................... 21  3.6.4 Sediment Mobilization ........................................................................................................................... 21  3.6.5 Summary of Effects to Forage Fish ...................................................................................................... 21  3.7 Benthic Infauna and Epifauna ........................................................................................................................ 22  3.7.1 Existing Conditions ............................................................................................................................... 22  3.7.2 Effects to Benthic Infauna and Epifauna ............................................................................................... 22  3.7.3 Culture Tube Placement Effects ........................................................................................................... 22  3.7.4 Predator Exclusion Netting Effects ....................................................................................................... 22  3.7.5 Harvest Effects ...................................................................................................................................... 23  3.7.6 Summary of Effects to Benthic Infauna and Epifauna ........................................................................... 24  3.8 Aquatic Vegetation ......................................................................................................................................... 24  3.8.1 Existing Conditions ............................................................................................................................... 24  3.8.2 Effects to Aquatic Vegetation ................................................................................................................ 24  3.9 Summary of Potential Effects......................................................................................................................... 25  4.0 REFERENCES ............................................................................................................................................... 27  Log Item 1 Page 115 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page iii TABLES Table 1. Underwater Noise Thresholds by Functional Hearing Group ......................................................................... 11  Table 2.  Clearance Rate Calculations for Pacific Oyster, Manila Clam, and Geoduck ................................................ 14  Table 3. Summary of Potential Effects from Geoduck Aquaculture ............................................................................. 25  FIGURES Figure 1. Smersh Parcel and Vicinity. ............................................................................................................................ 1  Figure 2. Proposed Geoduck Planting Area and Distances from High Water ................................................................ 2      Log Item 1 Page 116 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 1 1.0 INTRODUCTION BDN, Inc., (BDN) has leased parcel 721031007 (Smersh parcel) on Shine Road, in Squamish Harbor,  west of the Hood Canal Bridge and is proposing to operate a geoduck farm at the site (Figure 1). A  conditional use permit is required by Jefferson County and, as part of the permit application, a  habitat management plan and no net loss report are required (JCC 18.25.440).    The standard of “No Net Loss” of ecological functions was established by Washington State in the  Shoreline Management Act of 1971 and is implemented through a framework outlined in Jefferson  County’s Shoreline Master Program. This document presents an assessment of the proposed  aquaculture activities and demonstrates how geoduck aquaculture at the Smersh parcel will be  managed to achieve no net loss of ecological functions.  2.0 PROJECT DESCRIPTION The project, if approved with current design, will consist of the following elements as described  below. Potential impacts described herein are based on this current design.  BDN proposes to plant up to 5.15 acres of geoducks at the site between +2 feet and  approximately ‐2 feet relative to mean lower low water (MLLW) (Figure 2). The lower boundary of  planting has been determined based on the location of the eelgrass bed below  approximately ‐2 feet MLLW (Confluence 2016, Confluence 2018). To protect juvenile geoduck  Figure 1. Smersh Parcel and Vicinity  Log Item 1 Page 117 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 2 until they can burrow deep enough to avoid predators, PVC tubes 4 inches in diameter by 10  inches long will be placed into the sandy substrate. Tubes will be placed at an approximate density  of 1 tube per square foot with approximately 4 inches of the tube exposed above the substrate. All  tubes will be labeled with BDN contact information, including telephone number and email  address. Area netting may be placed over the tubes to prevent them from becoming dislodged  during severe weather and to reduce predation and theft.  Tubes will be removed after 18 to 24 months once the geoduck have reached a sufficient size and  depth to avoid predation. Geoduck will be harvested 5 to 7 years after planting.  Netting may  remain on the site until harvest to protect the crop from predation and theft.   2.1 Planting and Grow-Out Locations for geoduck clam aquaculture do not typically require much, if any, site preparation  prior to planting because they are located in sandflats or mudflats that do not have large substrate  materials. Substrate composition in the proposed culture area is primarily sand. Excessive  amounts of macroalgae (i.e., Ulva) will be hand‐raked away from the planting area, but left on‐site.  Successive tides will redistribute algae across the site. Non‐native dwarf eelgrass (Zostera japonica),  which is very sparsely distributed throughout the proposed planting area (Confluence 2016,  Confluence 2018), will not be removed during planting.  Native eelgrass (Zostera marina) will not  be disturbed and all geoduck planting will occur outside of the 16‐foot buffer from eelgrass bed as  Figure 2. Proposed Geoduck Planting Area and Distances from High Water  Log Item 1 Page 118 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 3 delineated by Confluence Environmental Company (Confluence) in July 2016 and reverified in  2017. Site preparation, if any, would occur at the same time as culture tube installation.  Geoduck seed are highly vulnerable to predation because of their small size and the shallow depth  at which they reside in the substrate when small. There will be no active predator removal from  the site. Predator control would be achieved through exclusion by planting geoduck seed into PVC  culture tubes, covering the tube with a mesh cap secured with a UV‐resistant rubber band, and  covering the bed with predator netting. PVC culture tubes are 4 inches in diameter and 10 inches  in length. Culture tubes will be positioned approximately 12 inches apart on center. Tubes would  be pushed into the substrate manually. PVC tubes typically extend approximately 4 inches.  Predator netting will be laid over the PVC tubes and secured to the substrate using rebar stakes to  further reduce predation and theft.  Predator netting has the added advantage of securing the PVC  tubes so that they do not wash away in the event of high wind and large waves.  After the culture tubes are removed, predator exclusion netting may be placed over the bed.  Predator exclusion nets will be placed directly on the sediment surface during this phase and  secured every 8 to 10 feet along the perimeter with U‐shaped rebar stakes. PVC tubes and predator  exclusion netting will be stored at an upland location when not in use.  Planting of seed will occur within the intertidal zone between approximately ‐2 feet and +2 feet  relative to MLLW, and may occur at any time of the year when growing conditions and tides are  suitable. Four juvenile geoduck will be planted in each tube. This will provide an initial density of  4 geoduck/square foot within the planting area. Planting will be completed by 12 to 25 workers on  the beach for approximately 5‐hour shifts. These workers will plant 8,000 to 10,000 geoduck per  shift by hand. With 12 to 25 workers, it will take 4 to 8 days to fully plant the beach. Planting will  begin in late spring and continue through mid‐fall as tides allow. At the end of every shift, any  leftover materials (e.g., PVC tubes, mesh caps, area nets) will be loaded onto the work skiff and  taken back to the staging area.   Routine maintenance of the proposed geoduck aquaculture area ensures that gear is preserved on‐ site, and will begin once gear has been installed. Maintenance will occur on a monthly basis, and  immediately following large storm events. Maintenance activities include monitoring shellfish  weight and health, picking up unnatural debris (if any), ensuring that predator netting is suitably  anchored to the substrate, ensuring that PVC tubes are not becoming dislodged from the substrate,  and any other general maintenance activity required. Crews must walk over the culture beds and  immediately adjacent areas to perform almost all activities that occur on the beds. This would  typically be done by a 2‐person crew over a 4‐hour period.  Log Item 1 Page 119 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 4 2.2 Maintenance 2.2.1 Site Inspection Regular site inspections will be made during low tides to ensure that tubes and netting have not  become dislodged and drifted onto the beach. All debris will be removed from the beach to  prevent it from entering the water. These regular inspections will continue until all tubes and  netting have been removed from the beach. Inspections will typically be made with 2 to 4 workers  and staged from the 24‐foot work skiff. Inspections will include monitoring for build‐up of drift  macroalgae. Ulva can unexpectedly inundate a given farm, covering tubes entirely and choking  out all sea‐life below, including juvenile geoduck clams. Drift algae is typically heaviest in late  spring to mid‐summer months. If a given farm area becomes heavily infested with the drift algae,  the algae can be picked up and moved to the top of the farm area where it can be distributed on  the upper beach portion that is not used for farming.  2.2.2 Cap Removal As soon as 6 to 12 months after planting, the mesh caps and rubber bands may be removed from  the tubes by hand. Prior to removal, caps will be inspected for herring spawn. If any herring  spawn is found, no caps will be removed until eggs have hatched. Once caps have been removed,  area netting will be laid over the tubes to stabilize them and keep them in the substrate, as the  growing geoducks will begin to push these out of the sand. Area netting will be secured with 24‐ inch rebar stakes placed vertically into the substrate as well as rebar stakes laid horizontally along  the netting. This method will ensure that netting cannot float free and become a safety or  navigation hazard.  2.2.3 Tube and Net Removal The tubes will be removed when the geoducks have reached a depth sufficient to avoid predators.  The depth to which the geoducks can burrow is typically substrate driven, and they tend to  burrow more quickly in sandy substrates versus those substrates containing a mixture of shell or  gravel. In sandier substrates, the geoducks may burrow to the desired protective depth of 18 to 24  inches in 18 months, whereas in substrates with more gravel, it may take as much as 24 months to  accomplish this. In either case, tube removal should be completed within 24 months of planting.  All gear installed on a particular beach must be removed during the lowest tides of the year. When  a particular beach is ready for gear removal, workers will come to the beach by boat and remove  all area nets to expose the tubes for removal by hand. Prior to removal, tubes and nets will be  inspected for herring spawn. If any herring spawn is found, no tubes will be removed until eggs  have hatched. After the area nets have been unstaked and removed to the work boat, workers will  remove and place the tubes (and caps if they haven’t already been removed) in large bags that will  be stored on the work boat until all the gear is removed from the site.  Log Item 1 Page 120 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 5 Tube and net removal will be done from winter to early summer to avoid Ulva buildup, as the  weight of accumulated Ulva can add thousands of pounds to nets. A crew of 10 workers will be  used to remove approximately 5,000 tubes per day.   2.3 Harvesting Geoduck clams will be harvested using either dry or wet (i.e., diving) harvest methods. Both  methods employ low‐pressure seawater that is pumped into the substrate through a 1‐ to 2‐inch‐ diameter, hand‐operated hose with a 0.5‐ to 0.6‐inch‐diameter PVC “stinger.” The stinger is  inserted into the sediment directly adjacent to a visible geoduck siphon. The pressure at the nozzle  is approximately equivalent to a garden hose (e.g., 40 pounds per square inch and 20 gallons per  minute). This method allows for the extraction of geoducks without the removal of large quantities  of overlying sediments. Pumps for the hoses would be run by small, boat‐based, internal  combustion engines located adjacent to the harvest site. Water intake lines on the pumps would be  fitted with screens that meet National Marine Fisheries Service (NMFS) screening criteria to  prevent fish entrainment.  Harvesting, either dry or wet, would be accomplished by 2‐ to 4‐person teams. Dry harvesting  would occur during a minus tide series (typically lasting 4 to 6 hours), and wet harvesting would  occur during a high tide series. The duration of harvest may exceed 4 to 6 hours a day if extended  high tide periods during the winter are coupled with the appropriate low tidal cycle to allow dive  harvest during daylight hours and beach harvest during the evening. Under most conditions, dry  and wet harvesting would not occur in the same day.  2.4 Habitat Management Plan Avoidance, conservation, and minimization measures that would be adopted at the proposed  geoduck farm are consistent with those outlined in relevant shellfish culture conservation  measures adopted by the U.S. Army Corps of Engineers (Corps) in their programmatic  consultation with the NMFS (2016a) and USFWS (2016) on Nationwide Permit 48 for shellfish  farming in the State of Washington. Avoidance of potential effects, where possible, is the priority.  The avoidance, conservation, and minimization measures at the proposed geoduck farm include  the following and are described in more detail in Sections 2.4.1, 2.4.2, and 2.4.3:   Maintenance, Repair, and Work   Species‐Specific Activities   Farm Plan Record‐Keeping Log  2.4.1 Maintenance, Repair, and Operation 1. Damage to aquatic vegetation and substrates from boats or barges will be minimized/  avoided through the following practices:   Measures shall be implemented to prevent anchors, chains, and ropes from dragging  on the bottom. Avoid anchoring over known native eelgrass beds. Log Item 1 Page 121 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 6  Boats and barges shall be moored and operated in deeper water and away from  aquatic vegetation to prevent potential impacts from propeller scour or anchors. If  boats need to come into the project area for personnel or gear access, then vessels  shall not ground in native eelgrass or attached kelp beds.   Intertidal areas shall not be used to store materials such as tools, bags, marker stakes,  rebar, or nets. Materials that are not in use or immediately needed shall be removed  to an off‐site storage area and the site kept clean of litter.   All excess or unsecured materials and trash shall be removed from the beach prior to  the next incoming tide.   Moving large substrate materials (e.g., logs, rocks) during aquaculture operations  shall be avoided to the extent feasible. Where the relocation of such features is  necessary, they shall be relocated no farther than another section of the nearby  beach.   There shall be no modification of substrate in an effort to improve conditions for  geoduck clam aquaculture.  2. Operators of vehicles or machinery will reduce contamination from vehicles and  equipment through the following practices:   Pump intakes (e.g., geoduck harvest) that use seawater shall be screened in  accordance with NMFS and Washington Department of Fish and Wildlife (WDFW)  criteria to protect fish life.    Unsuitable material (e.g., trash, debris, asphalt, or tires) shall not be discharged or  used as fill (e.g., used to secure nets, create berms, or provide nurseries).   All vessels operated within 150 feet of any stream, waterbody, or wetland shall be  inspected daily for fluid leaks before leaving the staging area. Repair any leaks  detected in the staging area before resuming operation.  3. At least once a month and directly following storm events, beaches in the project vicinity  shall be patrolled by crews who will retrieve aquaculture debris (e.g., predator exclusion  nets, tubes) that escape from the project area. Within the project vicinity, locations shall be  identified where debris tends to accumulate due to wave, current, or wind action, and after  weather events these locations shall be patrolled by crews who will remove and dispose of  debris appropriately.   4. The grower shall not use tidelands waterward from the line of mean higher high water  (MHHW) for the storage of aquaculture gear. All aquaculture gear shall be stored and  sorted at an upland facility and transported to the project area at the time of deployment.  Log Item 1 Page 122 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 7 5. The grower shall ensure that predator exclusion nets are secured to prevent them from  escaping from the project area.  6. Employees shall be trained in meeting environmental objectives.  2.4.2 Species-Specific Activities 1. A Pacific herring spawn survey shall be conducted prior to undertaking the activities listed  below if any of these activities occur outside the Tidal Reference Area 13 in‐water work  window, which is April 15 through January 14 (Washington Administrative Code [WAC]  220‐110‐271). Activities requiring a spawn survey include: (1) culture tube placement, (2)  geoduck harvesting, (3) predator exclusion net placement or removal, and (4) culture tube  removal. Vegetation, substrate, and aquaculture materials (e.g., nets, tubes) shall be  inspected for Pacific herring spawn. If herring spawn is present, these activities are  prohibited in the areas where spawning has occurred until the eggs have hatched and  spawn is no longer present (typically 2 weeks). Records shall be maintained, including the  date and time of surveys; the area, materials, and equipment surveyed; results from the  survey; etc. The record of Pacific herring spawn surveys shall be made available to the  Corps, NMFS, and U.S. Fish and Wildlife Service (USFWS), upon request.  2. Shellfish culturing shall not be placed above the tidal elevation of +7 feet MLLW if the area  is documented as surf smelt spawning habitat by WDFW (note the project will be confined  below +2 feet MLLW).   3. Shellfish culturing shall not be placed above the tidal elevation of +5 feet MLLW if the area  is documented as Pacific sand lance spawning habitat by WDFW (note the project will be  confined below +2 ft MLLW).   2.4.3 Farm Plan Record-Keeping Log Logs will be kept to record the timing, personnel, and findings of the following surveys and/or  cleanup activities.   1. Pacific herring spawn surveys: The grower shall maintain a record with the following  information and the record shall be made available upon request to the Corps, NMFS, and  USFWS: date of survey, location of area patrolled, surveyor name, and whether herring  spawn was observed in the project area.  2. Spills or cleanups conducted on the beach: The grower shall maintain a record with the  following information and the record shall be made available upon request to the Corps,  NMFS, and USFWS: date of patrol, location of areas patrolled, description of the type and  amount of retrieved debris, and other pertinent information.     Log Item 1 Page 123 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 8 3.0 EFFECTS ANALYSIS The “no net loss” standard contained in WAC 173‐26‐186 requires that the impacts of shoreline use  and/or development (e.g., geoduck aquaculture) be identified and mitigated such that there are no  resulting adverse impacts to ecological functions or processes. The Washington State Department  of Ecology (Ecology) defines no net loss as meaning that no significant adverse impacts to  preexisting ecological function shall occur as a result of proposed shoreline development. Jefferson  County further defines no net loss as “the maintenance of the aggregate total of the county  shoreline ecological functions over time.” Ecological function is defined by the County as “the  work performed or role played by the physical, chemical, and biological processes that contribute  to the maintenance of the aquatic and terrestrial environments that constitute the shoreline’s  natural ecosystem” (JCC 18.25.100(5)(a)).    In the following analysis, habitat and species indicators serve as a proxy for ecological function.   By avoiding impacts to species and the habitats upon which they rely, impacts to ecological  functions will be avoided as well.   The following specific factors are assessed in the following analysis of effects:   Noise   Water quality   Sediment quality   Sediment transport and bathymetry   Migration, access, and refugia   Forage fish   Benthic infauna and epifauna   Aquatic vegetation   Macroplastics, microplastics, and toxicity     Log Item 1 Page 124 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 9 3.1 Noise Changes in noise can result behavioral disturbance or, if loud enough, injury. The following  section describes existing noise conditions and expected effects of the proposed action.   3.1.1 Existing Conditions Existing sources and levels of airborne as well as underwater noise are described in this section.  3.1.1.1 Airborne Noise The uplands neighboring the proposed Smersh geoduck farm are rural residential, and they are  zoned as shoreline residential under the current Shoreline Master Plan for Jefferson County. There  are numerous single‐family residential houses in the Shine neighborhood which is bordered on the  north side by the heavily trafficked Sstate Route (SR) 104. Between 6,000 and 22,000 vehicles pass  the Shine neighborhood each day on SR 104 (15,000 average annual daily trips) traveling at 60  miles per hour (WSDOT 2017).  Existing noise in the area includes that which is typically found  associated with water‐dependent activities (e.g., boat use), residential uses (e.g., vehicle use, lawn  mowers, beach walking), and vehicular traffic. Using the standard that 10 percent of the average  annual daily traffic represents hourly average traffic (WSDOT 2018) leads to 1,500 vehicles per  hour passing near the Shine neighborhood on SR 104. At 60 mph the sound from vehicle traffic is  approximately 75 dBA at 50 feet (WSDOT 2018). This sound level attenuates to approximately 45  dBA at 800 feet which is approximately the halfway point between the Smersh parcel and SR 104.  The estimated noise level based on population density is approximately 40 to 45 dBA (FTA 2006).   3.1.1.2 Underwater Noise Measurements of ambient underwater noise were recorded at the Hood Canal Bridge in 2004.  Median background peak sound pressure was between 118.2 and 137.5 dBPEAK re 1 μPa and  median root mean squared (RMS) levels were 115 and 135 dBRMS re 1 μPa (Battelle 2005).  3.1.2 Effects of Noise Noise‐generating elements of the proposed project are consistent with existing use of the  surroundings (small boat use and walking on the beach). Both airborne and underwater noise  would be generated from the proposed project when boats are used to access the project site and  during the operation of pumps for harvest on a 5‐ to 7‐year cycle. The potential to affect fish and  wildlife in relation to noise is described below.  3.1.2.1 Effects of Airborne Noise The proposed project does not include the use of heavy equipment. Access to the site would occur  about once a month, and more frequently during limited periods for activities such as planting or  harvesting. Access would be via the upland parcels or via boat. The outboard motors typically  used on boats used for aquaculture typically create a noise level of about 60 dBA at 50 feet (Berger  et al. 2010). However, once at the site, the engine would be turned off until employees are ready to  Log Item 1 Page 125 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 10 leave. Small diesel‐ or gas‐powered water pumps with hoses would be used to harvest the  geoducks for several days every 5 to 7 years. While noise levels of the water pumps have not been  directly measured, they are considerably quieter than the outboards, referenced above, that  produce a sound level of 60 dBA at 50 feet. Based on an ambient noise level of approximately  40 dBA to 45 dBA, terrestrial noise associated with the proposed project is expected to attenuate to  ambient conditions 199 to 285 feet from the pumps. The landward margin of the geoduck planting  area is approximately 160 feet from the ordinary high water line, leading to the conclusion that  nearby residents will be exposed to only slight increases in noise if they approach within close  proximity to the shoreline near the project site.  Noise associated with aquaculture operations during planting, maintenance, and harvesting  activities could, if loud enough, result in temporary displacement of birds and/or masking of  communication among foraging birds. Strachan et al. (1995 as cited in USFWS 2009) observed that  marbled murrelets around heavy boat traffic do not appear to be adversely affected by the ambient  noise of urban areas. Other waterbirds have shown behavioral changes in response to noise, but  not to the extent that would cause population‐level effects as long as distances of approximately  164 feet to 328 feet are maintained from nesting habitats (Carney and Sydeman 1999, Borgmann  2010).  Because bald eagles are a state sensitive species in Washington, and protected under the federal  Bald and Golden Eagle Protection Act, there is an emphasis on ensuring that shoreline activities, in  general, do not disturb eagles. WDFW studied the response of nesting bald eagles for a 2‐year  period (1993‐1994) in relation to recreational pedestrian activity and wildstock geoduck harvest  activities within eight territories in Puget Sound (Watson et al. 1995). Eagles flushed in response to  4 percent of 890 potential disturbances, and only 1 of 34 responses was a result of geoduck harvest  activities. Effects to eagle foraging from geoduck harvest activity was considered statistically  insignificant at the frequency tested1, and eagles tended to forage evenly throughout the day with  or without a harvest vessel present. Similar effects are anticipated due to the proposed project.  The threshold for masking marbled murrelet communication is an in‐air noise level of 29 dB  sensation level (SL) or 29 dB above ambient noise level (Teachout 2013). This threshold was  informed by two critical hearing demands: (1) communication between conspecifics (at‐sea or in  terrestrial habitat), and (2) detection of the presence of corvid predators in terrestrial habitat. It is  unlikely that the noise generated by the proposed geoduck aquaculture operation would result in  masking marbled murrelet communication because the use of water pumps during a wet harvest  (the loudest noise source proposed for the project) is expected to increase noise levels by 15 dBA to  20 dBA above ambient noise levels (assuming 60 dBA produced by the water pump and 40 to 45  dBA ambient noise).   1 Frequency of geoduck harvest activities tested by Watson et al. (1995) included two weekday bouts when harvest boats were present, followed by two weekend control days when boats were absent, for a total of 296 observational bouts and 1,896 hours. Log Item 1 Page 126 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 11 Considering the distances from nesting sites from the proposed project area, negative effects  associated with increased human presence are not anticipated at this site. Even if some short‐term  avoidance behavior is observed, there is nothing to indicate that this reaction would impact the  overall foraging ability of birds present in the project area. Therefore, it is unlikely that such  temporary displacement from foraging activities in the limited project area would result in  reduced foraging success, nesting success, or fitness of overwintering birds. This concurs with the  conclusions reached by USFWS (2016), that determined exposures and effects of aquaculture‐ related noise to marbled murrelets are insignificant.  3.1.2.2 Effects of Underwater Noise Underwater noise would also be generated from the motors on boats used to transport gear and  personnel to the project area and the small engines used for the water pumps during a geoduck  harvest. Underwater noise thresholds for fish, cetaceans, pinnipeds, and marbled murrelets are  presented in Table 1.   Table 1 Underwater Noise Thresholds by Functional Hearing Group Functional Hearing Group Underwater Noise Thresholds Behavioral Disruption Threshold Injury Threshold Fish > 2 grams Fish < 2 grams Fish all sizes 150 dB RMS 187 dB Cumulative SEL 183 dB Cumulative SEL Peak 206 dB Marbled Murrelet 150 dB RMS* 208 dB SEL (barotrauma) 202 dB SEL (injury) Low-Frequency (LF) Cetaceans 120 dB RMS** LE,LF,24h:199 dB Cumulative SEL (non-impulsive sound source) Mid-Frequency (MF) Cetaceans 120 dB RMS** LE,MF,24h: 198 dB Cumulative SEL (non-impulsive sound source) High-Frequency (HF) Cetaceans 120 dB RMS** LE,HF,24h: 173 dB Cumulative SEL (non-impulsive sound source) Phocid Pinnipeds (PW) (Underwater) 120 dB RMS** LE,PW,24h: 201 dB Cumulative SEL (non-impulsive sound source) Otariid Pinnipeds (OW) (Underwater) 120 dB RMS** LE,OW,24h: 219 dB Cumulative SEL (non-impulsive sound source) 1 dB re 1 μPa2 -sec = sound exposure level (SEL) RMS = root-mean-square; this is the square root of the mean square of a single pile driving impulse pressure event *USFWS considers this to be a guideline, not a threshold ** NMFS’s interim sound threshold for behavioral effects Source: NMFS 2016b, Teachout 2013   To estimate underwater noise that might result from geoduck aquaculture, we reviewed Table 3.73  of Wyatt (2008) to find a close approximation of the underwater noise generated from boats that  would be used for the proposed project. In order to estimate the worst‐case scenario for  underwater noise, the parameters used for this analysis were the 21‐ft Boston Whaler vessel with a  250 horsepower Johnson 2‐cycle outboard motor operating at full speed and producing sound  measured at 147.2 dB RMS re 1μPa at 1 meter. Following Equation 1, underwater sound of this  level attenuates to the disturbance sound level for marine mammals 213 feet from the boat. Sound Log Item 1 Page 127 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 12 levels produced by the boat do not reach injury levels for any marine mammal group.  Nor do  sound levels reach disturbance or injury levels for murrelets and fish.     Equation 1 R1 (in meters) = R2 (in meters)*10((V‐120)/15)    R1 = 1m*10(147.2 dB‐120 dB)/15)    R1 = 65 m (213 ft)  Where:  R1 = range in meters of the sound pressure level; R2 = distance from the sources of the initial  measurement; V = transmission loss; and dB = decibels  3.1.3 Summary of Noise Effects According to NMFS’s 2009 assessment of potential impacts to endangered species due to geoduck  aquaculture activities, “A very low level of vessel operations will be associated with the  aquaculture activities (small and larger work boats and barges). Vessels would remain relatively  immobile until work is complete, with minimal sound and insignificant potential for disturbance.”   There is no evidence that increases in either airborne or underwater noise from the use of boat  motors or water pumps associated with the rearing and harvest of geoducks would result in  negative effects to fish and wildlife species. Noise resulting from aquaculture operations  throughout Washington State was reviewed with respect to potential effects to Endangered  Species Act (ESA‐listed fish, marine mammals, and marbled murrelets (NMFS 2009, USFWS 2009,  NMFS 2011). These reviews found that noise levels did not exceed disturbance thresholds that  would affect foraging, migration, reproduction, or fitness for any of the ESA‐listed species in Puget  Sound. The proposed shellfish aquaculture operation in Squamish Harbor would not significantly  alter noise above existing background conditions. Therefore, harvest operations are not anticipated  to increase underwater noise to a level that will result in a loss of ecological functions  3.2 Water Quality This section describes existing water quality conditions and the expected effects of the proposed  project.  3.2.1 Existing Conditions Water quality effects are a function of water circulation (or flushing rate and transportation) and  inputs into the system. Due to its proximity to the entrance to Hood Canal, Squamish Harbor   flushes quickly compared to southern Hood Canal. No waters near the project area are listed on  the Federal Clean Water Act Section 303(d) list (Ecology 2018), indicating that upland sources of  pollution are low and circulation maintains good water quality parameters.   Log Item 1 Page 128 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 13 3.2.2 Effects to Water Quality Potential effects to water quality and fish and wildlife species or their habitat are different for the  various phases of potential aquaculture activities. The following discussion is broken down into  (1) filtration effects and (2) harvest effects.   3.2.3 Filtration Effects Per Thom et al. (2008), Pacific Northwest estuaries are light limited, which reduces the depth at  which eelgrass and other light‐dependent species (e.g., macroalgae/kelp) can be successful.  Shellfish aquaculture can result in a beneficial reduction in turbidity due to removal of  phytoplankton and particulate organic matter through filtration (Peterson and Heck 2001, Newell  and Koch 2004, Cranford et al. 2011). By consuming phytoplankton and particulate organic matter,  shellfish decrease turbidity, thereby increasing the amount of light reaching the sediment surface  that is available for photosynthesis (Dame et al. 1984, Koch and Beer 1996, Newell 2004, Newell  and Koch 2004). Improvements to water clarity and light penetration can improve habitat  conditions that promote the growth of submerged aquatic vegetation (SAV) and other aquatic  vegetation.   A large body of literature indicates that shellfish aquaculture, or the presence of a dense bivalve  community, may provide some control of human nutrient loading to water bodies (Newell 2004,  Shumway et al. 2003, Newell et al. 2005, Burkholder and Shumway 2011, Kellogg et al. 2013, Banas  and Cheng 2015, Bricker et al. 2015). Bivalves remove more nutrients from the water column than  they input as biodeposits, which can have a net benefit to water quality. As bivalves filter organic  matter from the water column, they assimilate nitrogen and phosphorus into their shells and  tissue. When shellfish are harvested, the sequestered nutrients are permanently removed from the  system. According to Newell (2004), this process of bioextraction is one of the only methods  available that removes nutrients after they have entered an aquatic system, which can then make  that system more resilient to nutrient loading and, ultimately, decreases in dissolved oxygen.   High nutrient loading, and resulting decreases in dissolved oxygen, are a known problem in Hood  Canal. Similarly, bivalve filter‐feeding also serves an important role in improving water quality  conditions through benthic‐pelagic coupling, which is when biodeposits become incorporated into  surficial sediments, and microbially mediated processes facilitate nitrification‐denitrification  coupling to permanently remove sediment‐associated nitrogen as nitrogen gas.  The amount of benefit to water quality is dependent on species‐specific filtration rates. A recent  effort to calculate filtering capacity within south Puget Sound (Ferriss 2015) compiled clearance  rates for Pacific oyster, Manila clam, and geoduck (Table 2). According to Banas and Cheng (2015),  a modeling study that used the data compiled by Ferriss (2015), the potential for local control by  shellfish was shown to be possible in areas with reduced circulation such as Henderson, Eld,  Totten, Hammersley, and upper Case inlets, and Oakland Bay. While Banas and Cheng’s study  focused on southern Puget Sound, Hood Canal exhibits similar circulation patterns and clearance  rates when compared to southern Puget sound. Therefore, shellfish filtration could have a positive  Log Item 1 Page 129 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 14 influence on local water quality parameters, even if small compared to the inputs into the system  from residential development, municipal wastewater, agriculture, or other non‐point sources.  Table 2 Clearance Rate Calculations for Pacific Oyster, Manila Clam, and Geoduck Species Indiv. Wwet (g) L hr-1 indiv-1 L hr-1 Wwet-1 Source Pacific oyster 11.52 3 0.260 Kobayashi et al. 1997, Ruesink et al. 2006 Manila clam 18.19 1 0.060 Ruesink et al. 2006, Solidoro et al. 2003 Geoduck 980 3 0.003 Davis 2010 Source: Ferriss 2015, Banas and Cheng 2015   An example of the potential benefits offered by shellfish filtration and nutrient sequestration is  provided by Kellogg et al. (2013), who partially quantified the removal of nutrients from the water  column at a subtidal oyster reef restoration site compared to an adjacent control site in the  Choptank River within Chesapeake Bay, Maryland. The authors indicated that denitrification rates  at the oyster reef in August were “among the highest ever recorded for an aquatic system.” In  addition, a significant portion (47% and 48%) of the available nitrogen and phosphorus were  sequestered in the shells of live oysters and mussels. An ancillary benefit of the shellfish reef  structure, which is also true for shellfish aquaculture, was that the structure and faunal  composition provided ample microhabitats for communities of nitrifying microbes. One of the  conclusions by Kellogg et al. (2013) was that oyster reef restoration could be considered a “safety  net” to reduce additional downstream impacts to water quality. Because geoduck aquaculture  provides many of the same benefits, with the added benefit of the total removal of  anthropogenically derived nutrients at harvest, commercial shellfish aquaculture can be  considered a net benefit to water quality ecosystem functions.  3.2.4 Harvest Effects During harvest, suspended sediment and turbidity can be increased for a short period near the  harvest activity. Harvest events are limited in space (about 0.1 acre per day), duration (4 to 6 hours  per day), and occurs infrequently (once every 5 to 7 years) compared to the entire culture cycle.  The intensity and duration of turbid conditions are related to the concentration of suspended  sediment, suspended sediment grain size, water temperature, currents, and tidal flow conditions  at the site (NMFS 2009). Golder (2016) modeled sediment movement and suspension of sediment  (primarily sand) disturbed during a geoduck harvest in Case Inlet. Sediment particles were shown  to settle back to the bed rapidly and only a minor fraction was transported a distance of about 300  feet. This result is consistent with total suspended solids (TSS) collected by Short and Walton  (1992) during a geoduck harvest in the Nisqually Reach, where it was noted that most sediment  was deposited within 3 feet of the harvest hole, and only “small quantities of material” were  transported beyond 150 feet from the harvest zone. TSS measured by Short and Walton (1992) at  the harvesting location ranged from 4 to 21 mg/L. While a visible harvest plume persisted for  approximately 30 minutes after harvest and extended approximately 330 feet down current, almost  Log Item 1 Page 130 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 15 all TSS measurements within 131 feet of the harvest were shown to be within 1 mg/L of  background TSS.   New research from Fisheries and Oceans Canada, Pacific Biological Station in British Columbia,  Canada, has shown similar or lower effects from wet geoduck harvest events. A 2‐year research  program in both intertidal and subtidal habitats reported that the measurable sediment plume  generated during a geoduck harvest event was generally limited to within approximately 16 feet of  the harvest plot, and TSS levels were similar to those reported during typical storm conditions (Liu  et al. 2015). In addition, a harvest event did not result in significant changes to sediment grain size  down‐current.  Cornwell et al. (in review) evaluated the nutrients released from a typical commercial geoduck  harvest using low‐pressure water hoses. The study found that: (1) the amount of nutrients released  into the water column during harvesting is low, (2) the moderate concentrations of nitrogen and  phosphorus found in sediments and released during harvest make a relatively small contribution  to overall nutrient discharges into Puget Sound, and (3) localized effects are likely to be negligible.  A typical geoduck harvest event is limited in space (about 0.1 acre for 1 day), duration (4 to 6  hours), and occurs infrequently with respect to the entire culture cycle (i.e., 5‐ to 7‐year grow‐out  period prior to harvest). In comparison, a typical storm event in Puget Sound occurs once per  month and transports material over thousands of kilometers. Therefore, both the timing and  intensity of activities are well below the natural disturbance regime of a typical Puget Sound  habitat and harvest is not anticipated to result in loss of ecological functions.  Exposure to high levels of suspended sediment can cause behavioral stress in fish (e.g., gill  flaring), sublethal effects (e.g., gill damage, increased susceptibility to disease), or reduced survival  and growth. Newcombe and MacDonald (1991) suggested that a good indicator of suspended  sediment effects is the product of sediment concentration and duration of exposure. Fisher et al.  (2008) evaluated whether the TSS generated during a harvest event could result in significant  effects to fish using the suspended sediment risk assessment model developed by Newcombe and  Jensen (1996). The results indicate that fish are likely to exhibit avoidance responses to the  localized TSS levels generated during a harvest event. Because there is no confinement of the  harvest area (i.e., the site is located along an open shoreline) there is no mechanism to entrap fish  and expose them to increased suspended sediments for a significant amount of time.  Published literature that addresses suspended sediment effects to juvenile and larval estuarine  fishes also report limited effects at the concentrations generated during a geoduck harvest event.  Juvenile Chinook salmon have been observed to increase their rates of foraging in relation to  increased turbidity (18‐150 nephelometric turbidity units [NTUs]), which was attributed to the  increase in cover provided by turbid waters (Gregory and Northcote 1993, Gregory 1994). The  maximum concentration of turbidity that juvenile Chinook salmon experienced before reduced  foraging was observed was 150 NTUs for individuals that were 2 to 3 inches in fork length  (Gregory 1994). Studies have also reported increased feeding incidence and intensity for larval  Log Item 1 Page 131 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 16 Pacific herring at TSS concentrations ranging from 500 mg/L to 1,000 mg/L (Boehlert and Morgan  1985). Boehlert and Morgan (1985) attributed the enhanced feeding to improved “visual contrast of  prey items on the small perceptive scale used by the larvae.” Finally, Griffin et al. (2012) noted that  TSS levels of 400 mg/L did not result in adverse effects for Pacific herring larvae for exposure times  of 16 hours. All of the TSS and turbidity levels noted in these examples are either within or  significantly higher than levels measured during a geoduck harvest, indicating that a harvest  would be unlikely to raise TSS to a level or duration that would have negative effects on salmon  and forage fishes. Also, environmental effects of geoduck harvests have been shown to be similar  to, or less than, the effects of periodic natural storms. Therefore, harvest activities are unlikely to  have a negative effect on fish.  3.2.5 Summary of Effects to Water Quality Bivalves can improve water quality and mitigate anthropogenic sources of nitrogen in coastal  systems through filtration of nitrogen by absorbing phytoplankton in the water column (Newell  2004, Lindahl et al. 2005, Zhou et al. 2006). Conversely, a harvest event can potentially impact  water quality. Although a harvest event may increase suspended sediment for short periods of  time (one to two tidal cycles), it is typically confined to a small area (from 3 feet to 150 feet from  the harvest area) and occurs infrequently (every 5 to 7 years).  Fish would be expected to either avoid the sediment plume generated during a geoduck harvest or  use the plume as a foraging opportunity. Suspended sediment and turbidity levels measured  during geoduck harvest events were within or lower than the range in which juvenile Chinook  salmon and Pacific herring larvae were observed to successfully forage (Boehlert and Morgan  1985, Gregory 1994). Overall, effects from suspended sediments are considered insignificant and  habitat may potentially be improved in local areas if shellfish improve water quality conditions.  No net loss of ecological function is anticipated due to water quality impacts from geoduck  aquaculture.  3.3 Sediment Quality This section describes existing sediment quality conditions and the expected effects of the  proposed action.  3.3.1 Existing Sediment Conditions No sediment quality studies have been completed for the specific project site but the lack of  historic industrial development in Hood Canal indicates that sediment is unlikely to contain  deleterious substances regulated by the state.  Substrate at the Smersh site consists mainly of  well‐sorted, clean sand.  Log Item 1 Page 132 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 17 3.3.2 Effects to Sediment Quality Bivalve filter feeding serves an important role through benthic‐pelagic coupling, which is the  consumption of nutrients (via filtration of phytoplankton) and creation of biodeposits (feces and  pseudofeces). Nitrogen and phosphorus that are not digested are excreted as soluble ammonia and  biodeposits in the form of feces. When these biodeposits become incorporated into aerobic,  surficial sediments, microbially mediated processes facilitate nitrification‐denitrification coupling  to permanently remove sediment‐associated nitrogen as nitrogen gas (Newell 2004, Kellogg et al.  2013).  The biodeposits created through bivalve filter feeding contribute to organic materials in the  sediment surface, as described above. Studies have identified changes in geochemical  characteristics associated with the sediment under predator exclusion netting when used in Manila  clam (or other hard clam) aquaculture operations, but the majority of literature indicates that these  changes do not represent negative impacts to the surrounding environment. According to Bendell‐ Young (2006) and Bendell et al. (2010), there may be statistically significant changes in the organic  content of sediments under Manila clam netting. However, other studies indicated that small,  detectable changes under netting do not appear to be significant in terms of overall impacts to  sediment quality (Spencer et al. 1997, Munroe and McKinley 2007). Further, many authors report  that effects from the use of predator exclusion nets are short‐term and do not persist following net  removal (Simenstad and Fresh 1995, Spencer et al. 1998). Based on a review of 35 peer‐reviewed  articles, Munroe et al. (2015) concluded that, “predator netting is an effective environmentally  acceptable means of farming clam crops.”  Effects from the use of predator exclusion netting in geoduck clam aquaculture may be similar to  Manila clam (or other hard clam) aquaculture, but the nets associated with geoduck clam  aquaculture may be present for a portion of the 7‐year culture cycle. This is compared to a nearly  constant presence of nets for Manila clam farming. Therefore, predator exclusion netting used for  geoduck aquaculture is unlikely to result in significant changes to sediment quality.  A study conducted for the Washington Sea Grant Geoduck Aquaculture Research Program  assessed the influence of geoduck aquaculture on sediment nutrient regeneration (Cornwell et al.  in review). During the culture period of the study, porewater nutrient concentrations of nitrogen  and soluble reactive phosphorus were higher at culture sites than at reference sites. The release of  nitrogen and phosphorus species during harvest resulted in a minor increase in nutrient  concentration of water surrounding the geoduck harvest, suggesting that the liquefication of  sediments does not release a large percentage of the accumulated nutrients in the porewater. The  authors concluded that when extrapolated to all Puget Sound cultivated geoduck harvest on a  daily basis, the harvest release of nutrients represents an inconsequential fraction of anthropogenic  inputs into Puget Sound, leading to the conclusion that geoduck harvest is unlikely to reduce  ecological function due to sediment or water quality effects.  Log Item 1 Page 133 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 18 3.4 Sediment Transport and Bathymetry This section describes existing sediment transport and bathymetry conditions and the expected  effects of the proposed action.  3.4.1 Existing Conditions Sediment along the north shore of Squamish Harbor is primarily sandy in the lower elevations  with gravel and cobble on the upper intertidal beach. The beach slopes gradually and has a  relatively high exposure to waves, winds, and currents during storm events. East of the project  area there is a high bluff composed of various layers of glacial sediment. The bluff is characterized  by massive erosion that threatens several structures on the top of the bluffs (ESA Adolphson et al.  2008). The shoreline is classified as unstable recent landslide (Ecology 1978). Net shore‐drift is to  the west as indicated by sediment accumulations on the east side of obstacles and the westward  prograding spit at the mouth of Shine Creek ESA Adolphson et al. 2008).  In the nearshore,  eelgrass beds are patchy in the intertidal zone and continuous below MLLW. Shoreline armoring is  prevalent along the north shore of Squamish Harbor, with about 26 percent of this reach armored  (Jefferson County 2008). A boat ramp extends onto the beach next to the project parcel, with a  parking lot located on fill. The effect of the armoring and boat ramp are unclear, but are likely  having at least a minor effect on sediment erosion and input.   3.4.2 Effects to Sediment Transport and Bathymetry No dredging or placement of fill is proposed as part of the project. The two types of potential  disturbances associated with shellfish aquaculture that could affect sediment transport and  bathymetry include: (1) addition of gear that slows the transport of sediments, and (2) pulse  disturbances due to effects of harvest activities (Dumbauld et al. 2009). These potential  disturbances are described below.  3.4.3 Addition of Gear Predator exclusion netting and culture tubes used in geoduck clam aquaculture can slow currents  near the substrate, resulting in accumulation of sediment under the nets. Golder (2011) estimated  the potential accumulation of sediment within the tubes from an existing geoduck aquaculture  operation in south Puget Sound. Based on a visual inspection, an average height of 2.5 ±0.5 inches  of sediment accumulation was reported within the 4 inches of tube that was exposed above the  sediment bed. This equates to a volume of approximately 31.4±6.3 cubic inches per tube. Golder  (2011) then calculated net accumulation over a 1‐acre area to be approximately 29.3 cubic yards  (cy) of sediment. This minor amount of net accumulation is expected to rapidly redistribute  through wave and current action after 1 or 2 tidal cycles (or a few days with typical wave  conditions) following the removal of nets and tubes.  Log Item 1 Page 134 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 19 3.4.4 Harvest Activities During a geoduck harvest, the overlying sediments are loosened around the clam by adding water  through a 0.5‐inch‐ to 0.6‐inch‐diameter hose. Although this activity results in minor, localized  changes in elevation and sediment grain size, both quickly return to baseline conditions post‐ harvest. At Samish Bay, Horwith (2009) reported that minor post‐harvest elevation drop was not  evident within 1 month of a harvest. Post‐harvest resettling of sediments occurs as water content  decreases, leading to an increase in shear strength and resistance to erosion. In laboratory  experiments with fine‐grained marine sediment, resistance to resuspension was shown to double  approximately every 12 hours (Southard et al. 1971 as cited in Short and Walton 1992). Therefore,  the sediment redeposited during a harvest event will tend to regain its original shear strength  within 1 or 2 days after harvest.    3.4.5 Summary of Effects to Sediment Tranport and Bathymetry In summary, geoduck harvest or the presence of culture tubes and/or predator exclusion nets does  not lead to significant negative effects to sediment transport or bathymetry. Minor changes in  elevation may persist for up to 1 month, but these effects are considered to be short‐term with no  lasting changes to the surrounding sediment structure. The changes associated with geoduck  aquaculture operations are insignificant compared to the dynamic nature of sediment distribution  potential (e.g., storms, littoral drift, etc.) along the shoreline associated with the project area. No  loss of ecological function is anticipated due to changes in sediment transport or bathymetry.  3.5 Migration, Access, and Refugia This section describes existing migration, access, predation, and refugia conditions and the  expected effects of the proposed project.  3.5.1 Existing Conditions Shine Creek, approximately 1.5 miles to the west supports chum and coho salmon and cutthroat  and steelhead trout spawning.  The Shine Creek estuary is likely rearing habitat for natal and non‐ natal juvenile pink, chum, coho, and Chinook salmon (ESA Adolphson et al. 2008). A small stream  enters Squamish Harbor near the project site (>150 feet to the north) and is presumed cutthroat  trout habitat (Correa 2003). This small stream does not support salmon because access to upstream  habitat is hindered by (1) the very small size of the stream, and (2) the steep gradient where the  stream flows through shoreline armoring (i.e., boulder riprap). Sand lance spawning has been  documented along the beach to the west of the project and herring are known to spawn in the  eelgrass beds offshore (Penttila 2000, Long et al. 2003).   The project site is a sandy, gravelly beach with no man‐made structures. Juvenile salmonids and  other fish may use the intertidal area, when inundated, for migration, access, and refugia.  Log Item 1 Page 135 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 20 3.5.2 Effects to Migration, Access, and Refugia Predator netting and PVC tubes are the only material planned for use in aquatic areas for this  project.  PVC tubes extend only 3 to 5 inches above the substrate surface. Predator netting, when  laid over PVC tubes, will add only an inch or less to the height of the tubes.  When predator  netting is used on the beach it will add only an inch or less to the height of the substrate.  No other  equipment is planned for use in the project and no excavation or alteration of the beach is planned.  Neither tubes nor netting will block migration or access to habitat in the project area.    The planting area is over 150 feet from the mouth of the nearby stream. All species of Puget Sound  salmon are well documented utilizing estuarine and nearshore habitat in their migrations from  their natal freshwater watersheds to the ocean and back (Duffy et al. 2010). Salmon are known to  feed in habitat similar to that found in the project area, ingesting amphipods, copepods, larval fish,  and terrestrial insects (Fresh et al. 2006). Depending on the tidal cycle, fish can easily swim over,  around, or through PVC tubes or predator netting, if necessary. Many researchers have reported  that aquaculture gear is similar (or superior) to adjacent eelgrass habitat in terms of the diversity  and abundance of benthic fauna and fish (Meyer and Townsend 2000, DeAlteris et al. 2004, Pinnix  et al. 2005, Powers et al. 2007).   Sand lance spawn in sandy substrate in the upper intertidal zone between MHHW and +5 feet  (MLLW) (Pentilla 2007). Because project planting, grow‐out, and harvest will not extend above +2  feet elevation, access to sand lance spawning habitat will not be reduced.  As long as the gear is properly maintained, geoduck culture tubes and predator exclusion nets in  the intertidal area are not expected to affect migration, access, or refugia pathways for fish that  utilize shallow water. The presence of aquaculture gear may even serve as additional foraging  habitat or cover from predators. No loss of ecological function is expected to occur due to effects to  migration, access, and refugia.  3.6 Forage Fish This section describes existing forage fish conditions and the expected effects of the proposed  project.  3.6.1 Existing Conditions Sand lance spawning has been documented along the beach to the west of the project and herring  are known to spawn in the eelgrass beds offshore (Penttila 2000; Long et al. 2003). Sand lance  spawn in sandy substrate in the upper intertidal zone between MHHW and +5 feet (MLLW)  (Pentilla 2007) and typically select substrate with a diameter between 0.2 and 0.4 millimeters. In  the project area, the substrate found in the elevation range sand lance typically spawn is primarily  gravel, which is sub‐optimal for sand lance spawning. A dense eelgrass bed is found in the  subtidal zone at least 16 feet from the proposed planting area.  Log Item 1 Page 136 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 21 3.6.2 Effects to Forage Fish There are two potential effects to forage fish from the proposed geoduck aquaculture operation,  including: (1) spawning habitat could be overlapped, and (2) forage fish spawning areas could  receive suspended sediments during a harvest event. The potential for these effects to be  significant to forage fish or their habitat in the project area are discussed below.  3.6.3 Spawning Habitat Overlap The proposed culture activities are not located at shoreline elevations where sand lance spawn.  Culture will be confined to the intertidal and subtidal zone below +3 MLLW, while the forage fish  spawn elevation begins at +5 MLLW.  Therefore, the proposed project is not expected to impact  spawning habitat of these forage fish species. When the site is accessed by boat, boats would not be  beached above +5 ft MLLW. Boats will be moored or grounded in areas waterward of +5 ft MLLW.  Foot traffic for routine maintenance and beach surveys for debris will use consistent paths and will  not occur where potential forage fish spawning habitat may exist.  In some cases, aquaculture gear can provide a new substrate for herring spawn attachment in an  otherwise unstructured environment. Growers will be trained by a WDFW‐certified biologist to  recognize herring spawn. If herring spawn is observed within the geoduck farm, then those areas  will be avoided until the eggs have hatched. This conservation measure has been adopted by the  Corps as part of the ESA consultation process with the Services on the Programmatic Consultation  for Shellfish Activities in Washington State Inland Marine Waters (NMFS 2016a, USFWS 2016).   Therefore, the proposed project will not result in a loss of ecological function due to the project  overlapping forage fish spawning habitat.  3.6.4 Sediment Mobilization If forage fish do spawn near the project area, there is a low potential for adversely impacting  spawning beds with sediment mobilized during harvest. Fines make up a small percentage of the  farm substrate, and sands (because they are denser) drop out of the sediment plume within a few  meters (Short and Walton 1992, Golder 2011). Therefore, there will be no loss of ecological function  due to effects to forage fish spawning habitat resulting from sediment mobilization.  3.6.5 Summary of Effects to Forage Fish Because the project does not overlap sand lance spawning habitat, and because farming activity  will halt if herring spawn are observed within the project area, no loss of ecological function is  anticipated due to negative effects to forage fish spawning. Additionally, because sediments  mobilized during geoduck harvest settle out of the water column within a few feet of harvest  activity, no net loss of ecological function is anticipated due to mobilized sediment.  Log Item 1 Page 137 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 22 3.7 Benthic Infauna and Epifauna This section describes existing benthic infauna and epifauna conditions and the expected effects of  the proposed action.  3.7.1 Existing Conditions Observations of epifauna in the proposed project area were consistent with Puget Sound sandflat  habitats (Dethier 1990, Dethier and Schoch 2005). Species observed at the project site include  various amphipods, various isopods, various polychaete worms, sand sole, English sole, various  sculpins, various shrimp, Dungeness crab, red rock crab, and various hermit crabs,    3.7.2 Effects to Benthic Infauna and Epifauna Geoduck aquaculture may affect the benthic faunal community, including community changes  during: (1) culture tube placement, (2) use of predator exclusion nets, and (3) harvesting. The  effects of each action, the relative recovery period, and potential effects to benthic fauna are  discussed below.  3.7.3 Culture Tube Placement Effects Placement of culture tubes is not expected to significantly affect benthic epifauna. Once the tubes  are placed, they are rapidly encrusted with epibiota that create a reef‐type structure and a biogenic  source for associated food organisms of juvenile salmonids (Cheney 2009, VanBlaricom et al. 2013).  Specific studies evaluating the use of geoduck farms by salmonids and other fish are ongoing.  However, based on shellfish aquaculture studies in similar sandflat habitats, the effects from a  tube field are likely beneficial to salmonids because of the additional food resources available  (Cheney 2009, NMFS 2011, NMFS 2016b, USFWS 2016). In fact, NMFS (2016b) concluded that  increased densities of benthic infauna at intertidal geoduck clam aquaculture sites may persist  even after removing the protective PVC tubes and netting. For example, at one aquaculture site in  southern Puget Sound, ENVIRON 2008 (as cited in NMFS 2016b) found the average number of  infaunal benthic organisms per sediment core from an unprotected seeded area was greater than  the density of infaunal benthic organisms found in a reference area located outside of the  aquaculture site. Thuesen and Brown (2011, as cited in NMFS 2016b) observed an increase in  biodiversity of benthic fauna in an intertidal geoduck farm using PVC tubes and predator nets,  and species richness was significantly higher compared to a control site and compared to a  geoduck farm without tubes and netting. Data from the Pacific Shellfish Institute (Cheney 2009)  documented up to a 30 percent increase of harpacticoid copepods (e.g., typical salmonid prey  items) on mesh tubes and nets at an existing geoduck aquaculture plot in Spencer Cove on  Harstine Island.  3.7.4 Predator Exclusion Netting Effects Based on a review of the pertinent literature, Powers et al. (2007) noted that protective netting  placed over hard clam aquaculture sites supported elevated densities of mobile invertebrates and  Log Item 1 Page 138 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 23 juvenile fishes similar to natural seagrass habitats. A 5‐year study of Manila clam culture in the  River Exe  indicated that increased sedimentation under the netting resulted in increased benthic  productivity, although the infauna shifted from an assemblage dominated by predatory  polychaetes (before netting) to deposit feeders (after netting) that could exploit the increased  sedimentation and organic content (Spencer et al. 1996, 1997, 1998). Even in studies that have  shown minor changes to the benthic communities, the effects persisted as long as the nets were in  place and reverted to baseline conditions (or near baseline conditions) shortly after net removal or  harvest (Simenstad and Fresh 1995, Spencer et al. 1998, Munroe and McKinley 2007).   Potential effects to the benthic community from the introduction of PVC tubes with predator  exclusion nets was studied by McDonald et al. (2015). Effects on the benthic community from the  presence of geoduck aquaculture gear were found to be short‐term, with a short recovery period.  Similarly, as discussed above, the presence of shellfish aquaculture gear may increase benthic  invertebrate prey resources compared to what may be present without shellfish culture. Therefore,  presence of geoduck gear leads to an insignificant, or potentially beneficial, effect to benthic  infauna and epifauna.  3.7.5 Harvest Effects Shellfish harvest disrupts the sediment and results in the loss of some benthic fauna (Hall and  Harding 1997, Ferns et al. 2000), although that does not mean that the loss is a significant impact to  that resource. The recovery rate of infauna varies in response to the timing and magnitude of the  disturbance as well as the location of the site to populations of organisms and the mobility of  organisms affected (Dernie et al. 2003). Intertidal habitats are exposed to a wide range of natural  disturbance regimes that are dominated by physical processes such as tides, storm‐generated  waves, inter‐annual variation in climate, and nearshore sediment transport. It is generally  assumed that benthos found in more dynamic sand and gravel habitats will recover more quickly  following physical disturbance than those found in less energetic muddy habitats based on the  adaptive strategies of the respective assemblages found in these environments (Kaiser et al. 1998,  Ferns et al. 2000). Microcosm studies appear to support this hypothesis (Dernie et al. 2003). In  general, benthic infauna recovered very quickly (weeks to months) in terms of both diversity and  abundance from small‐scale disturbances, especially within clean sand communities.  Price (2011) and VanBlaricom et al. (2015) reported that potential effects to benthic invertebrates  from a geoduck harvest event are within the natural disturbance regime. This work compared the  benthic community within harvested and non‐harvested plots and found that effects to benthic  infauna during geoduck harvest are similar to effects resulting from wind and wave energy due to  natural storms. Detectable disturbances quickly become indistinguishable from control plots  (VanBlaricom et al. 2015). Recovery of the benthic infauna is relatively rapid after a geoduck  harvest event because infauna are still preserved in roughly the same location, leading to rapid  recolonization (Price 2011). In addition, because a harvest cycle occurs every 5 to 7 years, there  would unlikely be compounded effects due to repeated harvesting of the same area (Liu et al.  Log Item 1 Page 139 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 24 2015). The main conclusion from VanBlaricom et al. (2015) was that communities in Puget Sound  are well adapted to accommodate various types of disturbance. Because the frequency of  disturbance from geoduck harvest occurs at a much lower rate than storm events, infaunal and  epifaunal populations are unlikely to experience long‐term negative effects. Based on this  evaluation, it was determined that there were no long‐term measurable effects to resident  populations of invertebrates from geoduck harvest, and the intensity of potential effects was  equivalent to natural disturbances.  3.7.6 Summary of Effects to Benthic Infauna and Epifauna Overall, the research indicates that the benthic infaunal and epifaunal community is not affected or  returns to baseline, or near baseline conditions, once the gear is removed or harvest is complete  (VanBlaricom et al. 2013, Price 2011, McDonald et al. 2015, Liu 2015, VanBlaricom et al. 2015).  Small benthic invertebrates produce more than one generation per year and thus have rapid  recolonization rates. Intertidal species have adapted to habitat changes. Chronic low‐intensity or  sporadic medium‐intensity intertidal substrate disturbances are within the range of “behavioral or  ecological adaptability” (Jamieson et al. 2001). Therefore, no net loss in ecological function is  anticipated due to impacts to benthic infauna and epifauna.  3.8 Aquatic Vegetation This section describes existing submerged aquatic vegetation (SAV) conditions and the expected  effects of the proposed action.  3.8.1 Existing Conditions A dense bed of eelgrass extends from approximately ‐3 ft MLLW, waterward of the project area to  an unknown depth. A narrow band of sparse, patchy eelgrass is adjacent to the dense native  eelgrass bed between approximately ‐2 and ‐3 feet MLLW. No native eelgrass was identified  landward of the upper edge of the patchy eelgrass bed. Several very sparse patches of non‐native  dwarf eelgrass (Zostera japonica) were observed distributed throughout the project area.   Macroalgae beds are not found in or near the project area. Typical of sand‐ and silt‐dominated  habitats in Puget Sound, ulvoids were present at a very low density (<2% surface coverage)  throughout the mid‐ and low‐intertidal zone (approximately +2 to ‐2 feet MLLW) attached to hard  objects such as derelict clam shells.  3.8.2 Effects to Aquatic Vegetation Macroalgae density is anticipated to increase in the project area due to geoduck farming as the  PVC tubes and predator netting provide solid substrate required by macroalgae for attachment  and growth.   Log Item 1 Page 140 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 25 Because the project will be located outside of a 16‐foot protective buffer from native eelgrass, no  negative effects are anticipated to occur to eelgrass due to the proposed project.  No net loss in  ecological function will occur due to impacts to aquatic vegetation.  3.9 Summary of Potential Effects Although shellfish aquaculture can result in short‐term, localized changes, overall there is a  potential net gain, or at worst, insignificant effect, as demonstrated above. Table 3 is a summary of  potential direct effects for each parameter discussed above.  Table 3 Summary of Potential Effects from Geoduck Aquaculture Parameter Potential Effect Duration Level of Effect Noise  Airborne Noise: minor increase above background when boats or pump motors are in use  Underwater Noise: minor increase above background when boats motors are in use  Airborne Noise: during transit (boat motor) and during harvest (pump)  Underwater Noise: during transit  Airborne Noise: insignificant    Underwater Noise: insignificant Water Quality  Filtration: increased water clarity locally by reducing plankton blooms and nutrients  Harvest: increased suspended sediments and nutrients  Fish Behavior: avoidance or increased foraging  Filtration: during grow-out      Harvest: during harvest and for about 1-2 tidal cycles  Fish Behavior: during harvest  Filtration: beneficial (albeit small)  Harvest: insignificant  Fish Behavior: insignificant to beneficial Sediment Quality  Sediment quality: increased density of geoducks can result in increased organic content, especially with nets in place.  Sediment quality: when nets are in place (maximum of 2.5 years) and very minor during grow-out (5-7 years); not likely to be significant with good circulation  Sediment quality: insignificant Sediment Transport and Bathymetry  Tubes and nets: minor accretion of sediments within the tube area/under nets    Harvesting: changes to elevation and grain size  Tubes and nets: 2 years of grow- out cycle; baseline conditions within 1-2 tidal cycles  Harvesting: 1-4 months  Tubes and nets: insignificant      Harvesting: insignificant Migration, Access, and Refugia  Tubes: the vertical relief (4-5 inches) is different than sandflat habitat  Tubes: when tubes are present (2 years)  Tubes: insignificant Forage Fish  Spawning: potential overlap with forage fish spawning habitat; largely avoided with spatial separation and conservation measures  Sediment mobilization: sediment migrates to spawning beds; unlikely with wave energy  Larvae ingestion: forage fish larvae ingested by geoduck filter feeding; unlikely based on size  Spawning: planting, maintenance, and harvest        Sediment mobilization: harvest      Larvae ingestion: grow-out (5-7 years)  Spawning: insignificant        Sediment mobilization: insignificant  Larvae ingestion: insignificant Log Item 1 Page 141 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 26 Parameter Potential Effect Duration Level of Effect Benthic Infauna and Epifauna  Benthic fauna: potential increase of prey, but also short-term change of community structure  Benthic fauna: 2-3 years with nets and harvest; baseline conditions within several months; 6 months post-harvest  Benthic fauna: insignificant Aquatic Vegetation  Eelgrass and Attached Kelp: none present in project area  Macroalgae: drift macroalgae would be disturbed, but not taken out of the system  Eelgrass and attached kelp: not applicable  Macroalgae: planting, maintenance, and harvest activities  Eelgrass and attached kelp: not applicable  Macroalgae: insignificant      Log Item 1 Page 142 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 27 4.0 REFERENCES Banas, N.S. and W. Cheng. 2015. An oceanographic circulation model for south Puget Sound. In:  WSG (Washington Sea Grant), Shellfish Aquaculture in Washington State, Final Report to the  Washington State Legislature. December 2015. 92 pp.  Battelle Marine Sciences Laboratory. 2005. Hydroacoustic Measurements During Pile Driving at  the Hood Canal Bridge, September Through November 2004. Report PNWD‐3621 prepared for  the Washington State Department of Transportation.  Bendell, L.I., C. Duckham, T.L’Espérance, and J.A. Whiteley. 2010. Changes in geochemical  foreshore attributes as a consequence of intertidal shellfish aquaculture: A case study. Marine  Ecology Progress Series. 404:91‐108.  Bendell‐Young L.I. 2006. Contrasting the community structure and select geochemical  characteristics of three intertidal regions in relations to shellfish farming. Environ Conserv. 33:  21–27.  Berger, E.H., Neitzel, R., and Kladden, C.A., 2010. Noise navigator TM sound level database with  over 1700 measurement values. University of Washington, Department of Environmental &  Occupational Health Sciences, Seattle. Available at:  https://multimedia.3m.com/mws/media/893209O/children‐and‐hearing‐protection.pdf  Boehlert, G.W. and J.B. Morgan. 1985. Turbidity enhances feeding abilities of larval Pacific herring,  Clupea harengus pallasii. Hydrobiologia. 123: 161‐170.  Borgmann, K.L. 2010. A Review of Human Disturbance Impacts on Waterbirds. Audubon  California, Tiburon, California.  Bricker, S.B., J. Ferreira, C. Zhu, J. Rose, E. Galimany, G. Wikfors, C. Saurel, R. Landeck Miller, J.  Wands, P. Trowbridge, R. Grizzle, K. Wellman, R. Rheault, J. Steinberg, A. Jacob, E. Davenport,  S. Ayvazian, M. Chintala, and M. Tedesco. 2015. An Ecosystem Services Assessment using  bioextraction technologies for removal of nitrogen and other substances in Long Island Sound  and the Great Bay/Piscataqua Region Estuaries. NCCOS Coastal Ocean Program Decision  Analysis Series No. 194. National Oceanic and Atmospheric Administration, National Centers  for Coastal Ocean Science, Silver Spring, MD and United States Environmental Protection  Agency, Office of Research and Development, Atlantic Ecology Division, Narragansett, RI. 154  pp + 3 appendices  Burkholder, J.M. and S.E. Shumway. 2011. Bivalve shellfish aquaculture and eutrophication. In:  S.E. Shumway. Shellfish Aquaculture and the Environment. Wiley‐Blackwell, West Sussex, UK.  Carney, K.M. and W.J. Sydeman. 1999. A Review of Human Disturbance Effects on Nesting  Colonial Waterbirds. Waterbirds: The International Journal of Waterbird Biology. 22(1): 68‐79.  Log Item 1 Page 143 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 28 Cheney, D. 2009. Notes on data collected for National Marine Aquaculture Initiative. Provided by  Plauché & Carr on September 12, 2013.  Confluence (Confluence Environmental Company). 2016. Eelgrass Delineation – Final Report.  October 31, 2016. Prepared for BDN, Inc., Tacoma, WA.   Confluence (Confluence Environmental Company). 2018. BDN Inc. BDN Inc. ‐ Proposed Smersh  Geoduck Farm: 2018 Zostera marina bed edge re‐verification. Technical memorandum  prepared for BDN, Inc., Tacoma, WA.   Cornwell, J.C., M.S. Owens, and R.I.E. Newell. in review. The influence of culture and harvest of  geoduck clams (Panopea generosa) on sediment nutrient regeneration. Aquaculture.  Correa, G. 2003. Salmon and Steelhead Habitat Limiting Factors WRIA 16, Washington  Conservation Commission  Cranford, P.J., J.E Ward, and S.E. Shumway. 2011. Bivalve filter feeding: Variability and limits of  the aquaculture biofilter. In: S.E. Shumway (ed). Shellfish Aquaculture and the Environment.  Wiley‐ Blackwell, West Sussex, UK.  Dame, R.F., R.G. Zingmark, and E. Haskin. 1984. Oyster reefs as processors of estuarine materials.  J. Exp. Mar. Biol. Ecol. 83:239‐247.  Davis, J.P. 2010. DNR Molluscan Study DRAFT Report: clearance rate estimates in geoduck clams.  Department of Natural Resources, Olympia, Washington.   Dernie, K.M., M.J. Kaiser, and R.M. Warwick. 2003. Recovery rates of benthic communities  following physical disturbance. Journal of Animal Ecology. 72: 1043‐1056.   Dethier, M. 1990. A marine and estuarine habitat classification system for Washington State.  Washington Natural Heritage Program, Department of Natural Resources, Olympia,  Washington. 56 pages.   Dethier, M. and G. Schoch. 2005. The consequences of scale: Assessing the distribution of benthic  populations in a complex estuarine fjord. Estuarine, Coastal and Shelf Science. 62: 253‐270.  DeAlteris J.T., B.D. Kilpatrick, and R.B. Rheault. 2004. A comparative evaluation of the habitat  value of shellfish aquaculture gear, submerged aquatic vegetation and a non‐vegetated seabed.  Journal of Shellfish Research (2004) 23: 867‐874.  Duffy, E.J., D.A. Beauchamp, R.M. Sweeting, R.J. Beamish, and J.S. Brennan. 2010. Ontogenetic diet  shifts of juvenile Chinook salmon in nearshore and offshore habitats of Puget Sound.  Transactions of the American Fisheries Society. 139(3): 803‐823.  Log Item 1 Page 144 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 29 Dumbauld, B.R., J.L. Ruesink, and S.S. Rumrill. 2009. The ecological role of bivalve shellfish  aquaculture in the estuarine environment: a review with application to oyster and clam culture  in West Coast (USA) estuaries. Aquaculture. 290(3‐4): 196‐223.  Ecology (Washington Department of Ecology). 1978. Coastal Zone Atlas of Washington, Volume  Eleven, Jefferson County. General editor Carl Youngman.   Ecology. 2018. Washington State’s Water Quality Assessment and 303(d) list. Washington State  Department of Ecology, Water Quality Program, Olympia, WA  https://fortress.wa.gov/ecy/wqamapviewer/default.aspx?res=1366x768 (accessed May 25, 2018).  ENVIRON 2008?  FTA (Federal Transit Administration). 2006. Transit Noise and Vibration Impact Assessment  Guidance. FTA‐VA‐90‐103‐06. May, 2006.  Ferns, P.N., Rostron, D.M. and Siman, H.Y. 2000. Effects of Mechanical Cockle Harvesting on  Intertidal Communities. Journal of Applied Ecology, 37(3), pp.464‐474.  Ferriss, B. 2015. Appendix: Filtering capacity calculations. In: WSG (Washington Sea Grant),  Shellfish Aquaculture in Washington State, Final Report to the Washington State Legislature.  December 2015.  Fisher, J.P., M. Meaders, S. Luchessa, and K. Mueller. 2008. A supplemental analysis of the  environmental concerns associated with intertidal geoduck clam aquaculture: Effects of wild  geoduck genetics, potential for toxin resuspension, and effects on soft‐sediment associated  communities. ENVIRON International Corporation. Seattle, Washington. October 23, 2008.  Fresh, K.L., D.J. Small, H. Kim, C. Waldbillig, M. Mizell, M. Carr, and L. Stamatiou. 2006. Juvenile  salmon use of Sinclair Inlet, Washington, in 2001 and 2002. Washington Department of Fish  and Wildlife Technical Report No. FPT 05‐08. Olympia, Washington.  Golder (Golder Associates Inc.). 2011. Assessment of coastal sediments and shoreline morphology  impacts – proposed Longbranch shellfish farm: Shoreline Substantial Development permit –  Longbranch Shellfish Farm. Submitted by Golder. Submitted to Plauché & Stock. LLP (now  Plauché & Carr, LLP). February 15, 2011.  Golder. 2016. Coastal Sediments and Geomorphology Characterization of the Proposed Iverson  Geoduck Farm in Support of the Biological Assessment. August 31, 2016.  Gregory, R.S. 1994. The influence of ontogeny, perceived risk of predation, and visual ability on  the foraging behavior of juvenile Chinook salmon. Pages 271‐284. In: Stouder, D.J., K.L. Fresh,  and R.J. Feller (eds.). Theory and application in fish feeding ecology. Proceedings of  GUTSHOP ’92, The Belle W. Burach Library in Marine Science, no. 18. Log Item 1 Page 145 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 30 Gregory, R.S. and T.G. Northcote. 1993. Surface, Planktonic, and Benthic Foraging by Juvenile  Chinook Salmon (Oncorhynchus tshawytscha) in Turbid Laboratory Conditions. Canadian  Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 50: 233–240.  Griffin, F.J., T. DiMarco, K.L. Menard, J.A. Newman, E.H. Smith, C.A. Vines, and G.N. Cherr. 2012.  Larval Pacific herring (Clupea pallasi) survival in suspended sediment. Estuaries and Coasts.  35(5): 1229‐1236.  Hall, S.J. and Harding, M.J. 1997. Physical disturbance and marine benthic communities: the effects  of mechanical harvesting of cockles on non‐target benthic infauna. Journal of Applied Ecology,  pp.497‐517.  Horwith, M. 2009. Resilience of soft‐sediment communities after geoduck harvest in Samish Bay,  Washington. University of Washington, Department of Biology. Presentation to the Shellfish  Aquaculture Regulatory Committee (SARC).  Jamieson, G, R. O’Boyle, J. Arbour, D. Cobb, S. Courtenay, R. Gregory, C. Levings, J. Munro, I.  Perry, and H. Vandermeulen. 2001. Proceedings of the National Workshop on Objectives and  Indicators For Ecosystem‐based Management. Sidney, British Columbia, 27 February – 2 March  2001. CSAS Proc. Ser. 2001/09: 140 pp.   ESA Adolphson, Searun Consulting, LaRoche+Associates, and Coastal Geologic Services. 2008.  Jefferson County Shoreline Master Program Update Project – Final Shoreline Restoration Plan.  Prepare for Jefferson County Department of Community Development. Ecology Grant  #G0600343. October 2008.  Kaiser, M.J., Laing, I., Utting, S.D. and Burnell, G.M. 1998. Environmental Impacts of Bivalve  Mariculture. Journal of Shellfish research, 17(1), pp.59‐66.  Kellogg, M.L., Cornwell, J.C., Owens, M.S. and Paynter, K.T. 2013. Denitrification and nutrient  assimilation on a restored oyster reef. Marine Ecology Progress Series, 480, pp.1‐19.  Kobayashi, M., E.E. Hofmann, E.N. Powell, J.M. Klinck, and K. Kusaka. 1997. A population  dynamics model for the Japanese oyster, Crassostrea gigas. Aquaculture 149:285–321.   Koch, E.W., and S. Beer. 1996. Tides, light and the distribution of Zostera marina in Long Island  Sound, USA. Aquatic Botany. 53(1‐2): 97‐107.  Lindahl, O., R. Hart, B. Hernroth, S. Kollberg, L. O. Loo, L. Olrog, A. S. Rehnstam‐Holm, J.  Svensson, S. Svensson, and U. Syversen. 2005. Improving marine water quality by mussel  farming: A profitable solution for Swedish society. Ambio 34:131‐138.  Liu, W., C.M. Pearce, and G. Dovey. 2015. Assessing potential benthic impacts of harvesting the  Pacific geoduck clam, Panopea generosa, in intertidal and subtidal sites in British Columbia,  Canada. Journal of Shellfish Research 34(3), pp.757‐775. Log Item 1 Page 146 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 31 Long, K., N.E. Harrington and P.J. Mackrow. 2003. Forage fish spawning site investigation for  Eastern Jefferson County, Northeastern Kitsap County and North Mason County, North  Olympic Salmon Coalition. Second year status report to the Jefferson County Marine Resources  Committee.  McDonald, P.S., A.W.E. Galloway, K.C. McPeek, and G.R. VanBlaricom. 2015. Effects of geoduck  (Panopea generosa Gould, 1850) aquaculture gear on resident and transient macrofauna  communities of Puget Sound, Washington USA. Journal of Shellfish Research.  Meyer D.L., and E.C. Townsend. 2000. Faunal utilization of created intertidal eastern oyster  (Crassostrea virginica) reefs in the southeastern United States. Estuaries (2000) 23: 34‐45  Munroe, D., and R. S. McKinley. 2007. Commercial Manila clam (Tapes philippinarum) culture in  British Columbia, Canada: The effects of predator netting on intertidal sediment characteristics.  Estuarine, Coastal and Shelf Science 72:319‐328.  Munroe, D., J. Kraeuter, B. Beal, K. Chew, M. Luckenbach, and C.P. Peterson. 2015. Clam predator  protection is effective and necessary for food production. Marine Pollution Bulletin.  http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0025326X15300552   Nelson, T.A. and Waaland, J.R. 1997. Seasonality of eelgrass, epiphyte, and grazer biomass and  productivity in subtidal eelgrass meadows subjected to moderate tidal amplitude. Aquatic  Botany, 56(1), pp.51‐74.  Newell, R. I. E. 2004. Ecosystem influences of natural and cultivated populations of suspension‐ feeding bivalve molluscs: a review. Journal of Shellfish Research 23:51‐61.  Newell, R.I.E., and E.W. Koch. 2004. Modeling seagrass density and distribution in response to  changes in turbidity stemming from bivalve filtration and seagrass sediment stabilization.   Estuaries.  27: 793‐806.  Newell, R.I., Fisher, T.R., Holyoke, R.R. and Cornwell, J.C. 2005. Influence of eastern oysters on  nitrogen and phosphorus regeneration in Chesapeake Bay, USA. In The comparative roles of  suspension‐feeders in ecosystems pp. 93‐120.  Newcombe, C.P., and D.D. MacDonald. 1991. Effects of suspended sediments on aquatic  ecosystems. North American Journal of Fisheries Management 11(1):72‐82.  Newcombe, C.P., and J.O.T. Jensen. 1996. Channel suspended sediment and fisheries: A synthesis  for quantitative assessment of risk and impact. In North American Journal of Fisheries  Management 16:693‐727.  NMFS (National Marine Fisheries Service). 2009. Endangered Species Act Section 7 Formal  Programmatic Consultation and Magnuson‐Stevens Fishery Conservation and Management  Log Item 1 Page 147 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 32 Act Essential Fish Habitat Consultation for Nationwide Permit 48 Activities in Washington  State. National Oceanic and Atmospheric Administration, NMFS, Seattle, WA.  NMFS. 2011. Re‐initiation of Endangered Species Act Section 7 Programmatic Consultation and  Magnuson‐Stevens Fishery Conservation and Management Act Essential Fish Habitat  eNMFS. 2016a. Endangered Species Act Section 7 Formal Biological Programmatic Opinion and  Magnuson‐Stevens Fishery Conservation and Management Act Essential Fish Habitat  Consultation for Shellfish Aquaculture Activities in Washington State (COE Reference Number  NWS‐2014‐12  NMFS. 2016b. Technical Guidance for Assessing the Effects of Anthropogenic Sound on Marine  Mammal Hearing: Underwater Acoustic Thresholds for Onset of Permanent and Temporary  Threshold Shifts. U.S. Dept. of Commer., NOAA. NOAA Technical Memorandum NMFS‐OPR‐ 55, 178 p.  Penttila, D. 2000. Documented spawning areas of the pacific herring (Clupea), surf smelt  (Hypomesus) and Pacific Sand Lance (Ammodytes) in East Jefferson County. Washington State  Department of Fish and Wildlife, Marine Resources Division Manuscript Report.   Penttila, D.E. 2007. Marine forage fishes in Puget Sound. Prepared in support of the Puget Sound  Nearshore Partnership. Washington Department of Fish and Wildlife. Technical Report 2007‐ 03.  Peterson, B.J., and K.L. Heck, Jr. 2001. Positive Interactions between suspension‐feeding bivalves  and seagrass—a facultative mutualism. Marine Ecology Progress Series 213: 143‐155.  Pinnix W.D., T.A. Shaw, K.C. Acker and N.J. Hetrick. 2005. Fish communities in eelgrass, oyster  culture, and mudflat habitats of North Humboldt Bay, California. Final Report. U. S. Fish and  Wildlife Service, Arcata Fish and Wildlife Office, Arcata Fisheries Technical Report  Number TR2005‐02, Arcata, California.  Powers, M.J., C.H. Peterson, H.C. Summerson, and S.P. Powers. 2007. Macroalgal growth on  bivalve aquaculture netting enhances nursery habitat for mobile invertebrates and juvenile  fishes. Mar. Ecol. Prog. Ser. 339: 109‐122.  Price, J. 2011. Quantifying the ecological impacts of geoduck (Panopea generosa) aquaculture harvest  practices on benthic infauna. M.S. Thesis. University of Washington, Seattle, WA.  Ruesink, J.L., B.E. Feist, C.J. Harvey, J.S. Hong, A.C. Trimble, and L.M. Wisehart. 2006. Changes in  productivity associated with four introduced species: ecosystem transformation of a ‘pristine’  estuary. Marine Ecology Progress Series 311:203–215.   Log Item 1 Page 148 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 33 Short, K.S. and R. Walton. 1992. The transport and fate of suspended sediment plumes associated  with commercial geoduck harvesting, Final Report. Prepared for the State of Washington  Department of Natural Resources. Prepared by Ebasco Environmental, Bellevue, Washington.  Shumway, S.E., C. Davis, R. Downey, R. Karney, J. Kraeuter, J. Parsons, R. Rheault, and G.  Wikfors. 2003. Shellfish aquaculture – In praise of sustainable economies and environments.  World Aquaculture 34(4):15‐18.  Simenstad, C.A. and K.L. Fresh. 1995. Influence of intertidal aquaculture on benthic communities  in Pacific Northwest estuaries: Scales of disturbance. Estuaries and Coasts. 18(1):43‐70.  Solidoro, C., D.M. Canu, and R. Rossi. 2003. Ecological and economic considerations on fishing  and rearing of Tapes phillipinarum in the lagoon of Venice. Ecological Modelling 170:303–318.  Southard, J.B., R.A. Young, and C.D. Hollister. 1971. Experimental erosion of calcareous ooze.  Journal of Geophysical Research, 76(24), 5903‐5909. (as cited in Short and Walton 1992)  Spencer, B.E., M.J. Kaiser, and D.B. Edwards. 1996. The effect of Manila clam cultivation on an  intertidal benthic community: The early cultivation phase. Aquaculture Research. 27: 261‐276.  Spencer, B.E., M.J. Kaiser, and D.B. Edwards. 1997. Ecological effects of intertidal Manila clam  cultivation: Observations at the end of the cultivation phase. J. Appl. Ecol. 34(2): 444‐452.  Spencer, B.E., M.J. Kaiser, and D.B. Edwards. 1998. Intertidal clam harvesting: Benthic community  change and recovery. Aquaculture Research. 29(6):429‐437.  Strachan, G., M. McAllister, and C.J. Ralph. 1995. Marbled murrelet at‐sea and foraging behavior.  Pages 247‐53. In: Ralph, C.J., G.L. Hunt, M.G. Raphael, and J.F. Piatt (eds). Ecology and  conservation of the marbled murrelet. PSW‐GTR‐152. U.S. Department of Agriculture, Albany,  CA. 420 pp. (as cited in USFWS 2009)  Teachout, E. 2013. Conducting masking analysis for marbled murrelets & pile driving projects.  Presentation for WSDOT biologists and consultants. November 19, 2013.   Thom, R.M., S.L. Southward, A.B. Borde, and P Stoltz. 2008. Light requirements for grown and  survival of eelgrass (Zostera marina L.) in Pacific Northwest (USA) Estuaries. Estuaries and  Coasts 31:969‐980.  USFWS (U.S. Fish and Wildlife Service). 2009. Biological Opinion: Nationwide Permit #48 for  Shellfish Aquaculture, State of Washington. Endangered Species Act – Section 7 Consultation.  USFWS reference 13410‐2008‐F‐0461. Prepared for the U.S. Army Corps of Engineers by  USFWS, Washington Fish and Wildlife Office, Olympia, Washington. March 2009. 198 pp.  USFWS. 2016. Endangered Species Act – Section 7 Consultation Biological Opinion for the U.S.  Army Corps of Engineers – Seattle District Programmatic Consultation for Shellfish Activities  Log Item 1 Page 149 of 204 BDN Habitat Management Plan and No Net Loss Report – 2018 June 2018 Page 34 in Washington State Inland Marine Waters.  http://www.nws.usace.army.mil/Portals/27/docs/regulatory/160907/USFWS_Final%20BiOp_A Q%2020160826.pdf (accessed September 15, 2016).   VanBlaricom, G.R., A. J.L. Price, P.S. McDonald, J.R. Cordell, T.E. Essington, A.W.E. Galloway,  M.N. Dethier, and D.A. Armstrong. 2013. Evaluations of the ecological effects of geoduck  (Panopea generosa) aquaculture harvest practices on benthic organisms in southern Puget  Sound, 2008‐2012. Environmental and Land Use Hearings Office, Tumwater, Washington.  VanBlaricom, G.R., J.L. Price, J.D. Olden, and P.S. McDonald. 2015. Ecological effects of the harvest  phase of geoduck clam (Panopea generosa Gould, 1850) aquaculture on infaunal communities in  southern Puget Sound, Washington USA. Journal of Shellfish Research 34(1):171‐187.  Watson, J.W., D. Mundy, J.S. Begley, and D.J. Pierce. 1995. Responses of nesting Bald Eagles to the  harvest of Geoduck Clams (2002). Final Report. Washington Department of Fish and Wildlife,  Olympia, Washington, USA.  WSDOT. 2017. State Highway Log – Planning Report 2017 – SR 2 to SR 971.   WSDOT. 2018. Biological Assessment Preparation for Transportation Projects, Advanced Training  Manual. Washington State Department of Transportation, Environmental Services, Olympia,  Washington   Wyatt, R. 2008. Review of existing data on underwater sounds produced by the oil and gas  industry. Oil and Gas Producers (OGP) Joint Industry Program report on Sound and Marine  Life.  Zhou, Y., H. S. Yang, T. Zhang, S. L. Liu, S. M. Zhang, Q. Liu, J. H. Xiang, and F. S. Zhang. 2006.  Influence of filtering and biodeposition by the cultured scallop Chlamys farreri on benthic‐ pelagic coupling in a eutrophic bay in China. Marine Ecology Progress Series 317:127‐141.        Log Item 1 Page 150 of 204 146 N  Canal St, Suite 111  Seattle, WA 98103  www.confenv.com           Smersh Farm Visual Assessment‐ 2018  FINAL REPORT Prepared for:  BDN, Inc.  May, 2018  Apr 03 2019 Log Item 1 Page 151 of 204 146 N  Canal St, Suite 111  Seattle, WA 98103  www.confenv.com    Smersh Farm Visual Assessment‐ 2018  FINAL REPORT  Prepared for:  BDN, Inc.  Attn:  Brad Nelson  Prepared by:  Grant Novak  Confluence Environmental Company  May, 2018  Log Item 1 Page 152 of 204  Smersh Farm Visual Assessment – 2018  TABLE OF CONTENTS  1.0 INTRODUCTION .............................................................................................................................................. 1  2.0 VISUAL IMPACT ASSESSMENT METHOD .................................................................................................... 2  2.1 Overview .......................................................................................................................................................... 2  2.2 Inventory .......................................................................................................................................................... 3  2.3 Analysis ........................................................................................................................................................... 4  3.0 FINDINGS ......................................................................................................................................................... 5  3.1 Scenic Quality .................................................................................................................................................. 5  3.1.1 Environmental Condition ......................................................................................................................... 5  3.1.2 Spatial Definition ..................................................................................................................................... 5  3.1.3 Adjacent Scenery .................................................................................................................................... 6  3.2 Sensitivity Level ............................................................................................................................................... 6  3.2.1 Number of Viewers ................................................................................................................................. 6  3.2.1 View Duration.......................................................................................................................................... 6  3.3 Visibility ............................................................................................................................................................ 8  3.3.1 View Obstruction ..................................................................................................................................... 8  3.3.2 Distance Offshore/Observer Position ...................................................................................................... 9  3.3.3 Viewshed Coverage ................................................................................................................................ 9  3.4 Extent of Probable Visual Impact ..................................................................................................................... 9  4.0 REFERENCES ............................................................................................................................................... 10    FIGURES Figure 1. Smersh Parcel and Vicinity. ................................................................................................................... 1 Figure 2. Proposed Geoduck Planting Area and Distances from High Water ....................................................... 2 Figure 3.Visual Assessment Inventory Categories ................................................................................................ 4 Figure 4. Proportion of month the upper margin (Chart A) and lower margin (Chart B) of the geoduck planting will be visible based on NOAA tide data from Jan 1, 2012 to Dec 31, 2017. .......................................... 7 Figure 5. Proportion of Month Tidal Elevation Range is Within Farm Boundary ................................................... 8 Figure 6. Visual Impact Classifications .................................................................................................................. 9 Log Item 1 Page 153 of 204  Smersh Farm Visual Assessment – 2018  May 2018  Page 1  1.0 INTRODUCTION  BDN, Inc. has leased parcel 721031007 (Smersh parcel) on Shine Road west of the Hood Canal  Bridge and is proposing to operate a geoduck farm at the site (Figure 1). A conditional use permit  is requried by Jefferson County and, as part of the permit application, a visual assessment has been  requested by the County pusrsuant to Jefferson County code 18.25.440(4)(f).  The following  document presents an assessment of the potential effects to nearby uses and aesthetic qualities of  the shoreline that might occur due to geoduck aquaculture operations on the Smersh parcel.   BDN, Inc proposes to plant up to 5.15 acres of geoducks at the site between +2 feet and  approximately ‐2 feet relative to mean lower low water (MLLW) (Figure 2). The lower boundary of  planting has been determined based on the location of the eelgrass bed below approximately ‐2  feet MLLW (Confluence 2016). Geoduck will be planted outside of a 16 foot horizontal buffer from  the eelgrass bed (Figure 2). To protect juvenile geoduck until they can burrow deep enough to  avoid predators, PVC tubes 4” in diameter by 10” long will be placed into the sandy substrate.  Tubes will be placed at an approximate density of 1 tube per square foot with 3” to 5” of the tube  exposed above the substrate. All tubes will be labelled with BDN, LLC’s contact information,  including telephone number, and email address. Area netting may be placed over the tubes to  prevent them from becoming dislodged during severe weather.  Figure 1. Smersh Parcel and Vicinity.  Log Item 1 Page 154 of 204  Smersh Farm Visual Assessment – 2018  May 2018  Page 2  Tubes will be removed after 18‐24 months once the geoduck have reached a sufficient size and  depth to avoid predation. Geoduck will be harvested 5‐7 years after planting.  Netting may remain  on the site until harvest to protect the crop from theft and/or predation.     2.0 VISUAL IMPACT ASSESSMENT METHOD  2.1 Overview  This visual assessment follows protocols and methods outlined in the Department of Ecology’s  Aquaculture Siting Study (Ecology 1986) developed by the State of Washington to assess visual  effects that might be experienced due to aquaculture activities. In Ecology’s study, they  incorporated and expanded upon visual assessment techniques identified by the U.S. Forest  Service (USFS) and U.S. Bureau of Land Management (BLM) and refined the applicable techniques  to focus on assessments of aquaculture. The result is the Visual Assessment Workbook which  provides an analytical process for evaluating visual impacts of aquaculture.   The USFS identified nine assumptions related to visual quality that were adopted by Ecology in  their analytical process to assess visual impacts of aquaculture:  Figure 2. Proposed Geoduck Planting Area and Distances from High Water  Log Item 1 Page 155 of 204  Smersh Farm Visual Assessment – 2018  May 2018  Page 3  1. People have certain scenic expectations  2. View duration is critical;  3. Number of viewers is critical;  4. Diversity increases scenic value;  5. Retention of distinctive character is desirable;  6. Each setting varies in capacity to absorb visual alteration;  7. Landmarks/focal points receive critical scrutiny;  8. Viewing angle is critical; and  9. Viewing distance is critical.  The BLM identified three principles related to visual quality that were adopted by Ecology in their  analytical process to assess visual impacts of aquaculture:  1. Landscape character is primarily determined by the four basic visual elements of form,  line, color, and texture. Although all four elements are present in every landscape, they  exert varying degrees of influence.  2. The stronger the influence exerted by these elements, the more interesting the landscape.  3. The more visual variety in a landscape, the more aesthetically pleasing the landscape.  Variety without harmony, however, is unattractive, particularly in terms of alterations  (cultural modifications) that are made without care.  The principles and assumptions outlined by the USFS and BLM were incorporated by Ecology into  a visual assessment method that inventories the surrounding landscape to quantify visual  characteristics of the landscape and the proposed aquaculture operations, and incorporates the  landscape inventory scores within an analysis matrix to arrive at an overall visual impact score.  2.2 Inventory   The Ecology defined inventory of visual characteristics includes three categories: scenic quality,  sensitivity level, and visibility. Scenic quality incorporates individual rating scores of  environmental condition, spatial definition, and adjacent scenery to determine a high, moderate,  or low scenic quality rating. Site sensitivity level is an accounting of the number of potential  viewers and their potential view duration of the project area (i.e., Smersh geoduck farm). The  visibility category identifies key observation points and evaluates the visibility of the aquaculture  site based on obstructions, distance from viewer, and the amount of the viewers cone of vision  taken up by the aquaculture activity (Figure 3).    Log Item 1 Page 156 of 204  Smersh Farm Visual Assessment – 2018  May 2018  Page 4    2.3 Analysis   In the analysis step, the scores from the inventory of scenic quality, sensitivity level, and visibility  are incorporated into an overall score to determine the severity of the probable visual impact. The  four classifications of visual impact are:  1. Class I (Severe Visual Impact) – Any permanently visible aquaculture facility will likely  have a severe visual impact that cannot be mitigated for. This category is applicable only in  wilderness areas.  2. Class II (High Visual Impact) – Areas where permanently visible aquaculture facilities will  likely be visually obtrusive.    3. Class III (Moderate Visual Impact) – Areas where permanently visible aquaculture facilities  will be visually evident.   4. Class IV (Low Visual Impact) – Areas where existing visual disruptions dominate or areas  with low sensitivity/visibility.    Figure 3.Visual Assessment Inventory Categories  Log Item 1 Page 157 of 204  Smersh Farm Visual Assessment – 2018  May 2018  Page 5  3.0 FINDINGS  A site visit was made to the Shine neighborhood and surrounding locale on April 18, 2018 during a  daylight low tide to inventory the scenic quality, sensitivity level, and visibility of the area within  the viewshed of the proposed Smersh geoduck farm. A hard copy of the visual assessment  workbook was consulted during the site visit and notes and scores were cataloged in the  workbook (Appendix A) for incorporation into this assessment.  3.1 Scenic Quality   Scenic quality is a combination of environmental condition, spatial definition, and adjacent  scenery. Each of these elements is described in more detail below.  Summary Category Rating: Moderate scenic quality – Areas with a combination of some  outstanding features and some that are fairly common.   3.1.1 Environmental Condition  Environmental condition is the capacity of the landscape to accept human alteration without  losing its natural visual character.  3.1.1.1 Environmental Condition Rating  Individual Element Rating: Moderate  Environmental condition was rated as Moderate based on distinctive landscape character, the  nearby public park and public use area, and areas with visible evidence of human activity, but not  at a dominating level. The Smersh site is located on a heavily altered shoreline in a medium‐ density, residential neighborhood. The shoreline has been altered by rip rap hardening, there is a  concrete boat ramp and gravel parking lot in the adjacent public property, riparian trees have been  removed from a number of the adjacent properties to increase private views, and the paved  roadway is adjacent to the shoreline for approximately 1 mile to the west of the Smersh parcel.  3.1.2 Spatial Definition  Spatial definition is the degree of spatial enclosure and volume created by the flat plane of the  water body and the surrounding landforms.  3.1.2.1 Spatial Definition Rating  Individual Element Rating: Moderate  Spatial dfinition was rated as moderate based on the shoreline form with concave embayments ½  mile to 2 miles across. Squamish Harbor is approximately 2 miles across at the Smersh site and  Hood Canal is approximately 3 miles across at the Smersh site.  Log Item 1 Page 158 of 204  Smersh Farm Visual Assessment – 2018  May 2018  Page 6  3.1.3 Adjacent Scenery  Adjacent scenery refers to the adjacent shoreline edge, landform, and vegetation which define the  embayment.  Influence, detail, and clarity diminish with distance. In general, impact of this  variable increases as the degree of enclosure increases, or as the embayment size or the distance to  the opposite shoreline decreases.  3.1.3.1 Adjacent Scenery Rating  Individual Element Rating: Low  Adjacent scenery was rated as low based on the lack of variety in form, line, color, and texture.  Trees obscure views from neighboring residences, clear cutting is visible in the managed forests to  the west, managed forests are visible on all adjacent shorelines, and most shorelines being greater  than 1 mile from viewpoints.  3.2 Sensitivity Level  Sensitivity level refers to the number of potential viewers, adjacent travel routes, use areas, or the  amount of existing residential development.  Summary Category Rating: Low – few adjacent travel routes and medium‐density residential  development. Further, because geoducks will be located in the intertidal zone, they will be  underwater for the majority of the time and the duration when they are visible will be short. This  rating is described in more detail below.  3.2.1 Number of Viewers  Individual Element Rating: Low   This element was rated as low because the potential number of viewers of the Smersh Site is low.   At low tide, the upper margin of the geoduck planting at +2 feet elevation is visible from only 12  residences while the lower margin of the geoduck planting at ‐2 feet elevation is visible from only  20 residences (See Appendix B – Photos 11 and 12).  The site is not visible from the heavily‐ travelled state route 104 and, while it may be visible from Shine road during some tidal stages,  Shine road is a neighborhood access route and not heavily travelled.  The neighboring park is little  more than a boat ramp and gravel parking lot.  The boat ramp is only useable during high tide,  when the geoduck tubes would be submerged, so there is little opportunity for visitors to see  aquaculture activities.   3.2.1 View Duration  Individual Element Rating: Low  It is important to note that tides low enough to expose the planting area follow a seasonal pattern  in the Puget Sound region. Larger‐magnitude summer low tides occur during daylight hours,  Log Item 1 Page 159 of 204  Smersh Farm Visual Assessment – 2018  May 2018  Page 7  while winter low tides occur at night. Therefore, geoduck tubes and netting are more visible in  summer, and minimal in winter.  While the presence of medium‐density residential development may lead to a moderate score for  the Sensitivity Level category, aquaculture equipment and activities are only visible during  daylight low tides for a small percentage of each month. Figure 4 illustrates that the upper margins  of the geoduck planting area are visible a maximum of 16% of any single month (Chart A) and the  entire planted area is visible a maximum of only 2% of a month (Chart B) (NOAA 2018).      A. B.  Figure 4. Proportion of month the upper margin (Chart A) and lower margin (Chart B) of the  geoduck planting will be visible based on NOAA tide data from Jan 1, 2012 to Dec 31, 2017.    Figure 5 presents the tidal range in Hood Canal throughout the year overlaid by the farm  boundary. It should be noted that, while geoduck will be planted between +2 feet and ‐2 feet  elevation, the geoduck tubes may extend up to 4 inches (0.3 feet) above the sediment so the farm  boundary has been shown between ‐1.7 feet and +2.3 feet to represent the tidal elevation of the  geoduck tubes. As can be seen in Figure 5, tidal elevation seldom goes as low as the upper farm  boundary and even more rarely goes as low as the lower farm boundary, further illustrating that  the aquaculture activities will be exposed only a minor portion of a month.  Log Item 1 Page 160 of 204  Smersh Farm Visual Assessment – 2018  May 2018  Page 8    3.3 Visibility  Visibility is a combination of the following elements, which are discussed in more detail below:  view obstruction, distance offshore/observer position, and viewshed coverage.  Summary Category Rating: Low   Visibility is rated low due to obstructed views from vegetation and landform as well as large  distances between geoduck planting area and potential viewers. Also, geoduck tubes and nets  have very low relief and natural macroalgae colonizes equipment rapidly leading to natural color  and texture (See Appendix B – Photos for examples).  3.3.1 View Obstruction   View obstruction is related to the degree of obstruction in viewing the farm by vegetation,  landform, or man‐made objects.  3.3.1.1 View Obstruction Rating  Individual Element Rating:  Moderate – Partially obstructed view   15 to 20 homes have unobstructed view of the proposed geoduck planting area. During the site  visit, nearby trees were in the leaf‐off condition. The estimate of 15‐20 homes with unobstructed  views will be reduced during the summer when trees have a cover of leaves that are likely to more  fully block views.  Figure 5. Proportion of Month Tidal Elevation Range is Within Farm Boundary  Log Item 1 Page 161 of 204  Smersh Farm Visual Assessment – 2018  May 2018  Page 9  3.3.2 Distance Offshore/Observer Position  Visibility is critically related to the distance the farm is located from observation points and the  height of key observation points above sea level.  3.3.2.1 Distance Offshore/Observer Position Rating  Individual Element Rating: Low – Areas with little visibility  This element is rated low because distance from most potential viewers (i.e. visible residences and  Shine road) to aquaculture is greater than 1500 feet and between 20 feet and 50 feet above sea level.   3.3.3 Viewshed Coverage  Viewshed coverage is related to the percentage of the normal cone of vision occupied by the  proposed aquaculture facility.  3.3.3.1 Viewshed Coverage Rating  Individual Element Rating:  Low  The proposed geoduck planting area covers less than 5% of the cone of vision when viewed from  nearby residences. The project is only 500 feet wide along the nearly 2‐mile‐long northern  shoreline of Squamish Harbor.    3.4 Extent of Probable Visual Impact  Scores from the inventory of scenic quality, sensitivity level, and visibility are incorporated into an  overall score to determine the severity of the probable visual impact.  Scenic Quality Summary Category Rating: Moderate  Sensitivity Level Summary Category Rating: Moderate  Visibility Summary Category Rating:  Low  Figure 6. Visual Impact Classifications Log Item 1 Page 162 of 204  Smersh Farm Visual Assessment – 2018  May 2018  Page 10  Using the matrix provided in the Visual Assessment Workbook to determine the extent of visual  impact of the project site leads to a Class IV Low Visual Impact.  Because the site is visible only a  small portion of the time, the site is not visible from heavily traveled routes, the surroundings are  heavily altered by local residential, and the geoduck tubes and netting will quickly take on a  natural color due to colonization by aquatic flora and fauna (see photos 13‐16 in Appendix B).   Based on the resultant Class IV Low Visual Impact rating, the project should require no mitigation  measures to reduce visual effects.  4.0 REFERENCES  Confluence Environmental Company. 2016. BDN Eelgrass Bed Delineation – 2016 – Final Report.  October 31, 2016.  Ecology (WA State Department of Ecology). 1986. Aquaculture siting study. Prepared by EDAW  Inc. and CH2M/Hill for State of Washington Department of Ecology, Olympia.  National Oceanographic and Atmospheric Administration. 2018. Tides and Currents Website –  Tide Predictions at Gage 99445088 at Lofall, WA from 1/1/2012 to 12/31/2017.   https://tidesandcurrents.noaa.gov/noaatidepredictions.html?id=9445088&legacy=1 Log Item 1 Page 163 of 204       Appendix A Visual Assessment Workbook Log Item 1 Page 164 of 204 Log Item 1 Page 165 of 204 Log Item 1 Page 166 of 204 Log Item 1 Page 167 of 204 Log Item 1 Page 168 of 204 Log Item 1 Page 169 of 204 Log Item 1 Page 170 of 204 Log Item 1 Page 171 of 204 Log Item 1 Page 172 of 204 Log Item 1 Page 173 of 204 Log Item 1 Page 174 of 204 Log Item 1 Page 175 of 204 Log Item 1 Page 176 of 204 Log Item 1 Page 177 of 204 Log Item 1 Page 178 of 204 Log Item 1 Page 179 of 204     Appendix B Photos Log Item 1 Page 180 of 204 SMERSH FARM VISUAL ASSESSMENT – 2018 Appendix B: Photos May 2018 Page 1  Photo Index - Numbers correspond to the photos numbers in the following appendix. Arrows indicate the viewing direction of the photo. Log Item 1 Page 181 of 204 Smersh Farm Visual Assessment – Appendix B: Photos Page 2 May 2018     Photo 1 — View of proposed geoduck planting area from neighboring public boat ramp. Orange boundary is approximate location of proposed geoduck. Photo 2 — View of proposed geoduck planting area from western property boundary looking east. Log Item 1 Page 182 of 204 Smersh Farm Visual Assessment – Appendix B: Photos May 2018 Page 3 Photo 3 — View of proposed geoduck planting area looking east from neighboring public boat ramp.   Photo 4 — View from residential driveway approximately 1000 feet north of proposed geoduck planting area. Log Item 1 Page 183 of 204 Smersh Farm Visual Assessment – Appendix B: Photos Page 4 May 2018 Photo 5 — View from residential driveway approximately 500 feet north of proposed geoduck planting area.   Photo 6 — View from Shine Road approximately 400 feet northeast of proposed geoduck planting area. Note boat that is also visible in phots 1-3. Log Item 1 Page 184 of 204 Smersh Farm Visual Assessment – Appendix B: Photos May 2018 Page 5 Photo 7 — View from approximately 1500 feet east of proposed geoduck planting area from Shine Road looking in direction of farm. This view is typical of most residences in the area. The high bluff blocks views of the proposed aquaculture. This photo was taken at low tide but no exposed beach is visible.   Photo 8 — View from approximately 1500 feet east of proposed geoduck planting area from Shine Road looking in direction of farm. This view is typical of most residences in the area. The high bluff blocks views of the proposed aquaculture. This photo was taken at low tide but no exposed beach is visible. Log Item 1 Page 185 of 204 Smersh Farm Visual Assessment – Appendix B: Photos Page 6 May 2018 Photo 9 — View of active geoduck farm from Shine Road. Looking to east during low tide.   Photo 10 — View of active geoduck farm from Shine Road. Looking to west during low tide. Log Item 1 Page 186 of 204 Smersh Farm Visual Assessment – Appendix B: Photos May 2018 Page 7 Photo 11 — Houses with line-of-sight visibility to center of proposed aquaculture (approximately +1 feet MLLW). Orange circles indicate residences that may be able to see the farm when tides are low enough. Photo taken at 12:10pm on April 18, 2018. Tidal elevation approximately -0.35 feet MLLW. Photo 12 — Houses with line-of-sight visibility to lower margin of proposed aquaculture (approximately -2 feet MLLW). Orange circles indicate residences that may be able to see the farm when tides are low enough. Photo taken at 12:12pm on April 18, 2018. Tidal elevation approximately -0.34 feet MLLW. Log Item 1 Page 187 of 204 Smersh Farm Visual Assessment – Appendix B: Photos Page 8 May 2018 Photo 13 — Example of geoduck tubes colonized by natural flora and fauna within months of installation. Note scoters diving to feed on attached organisms. Photo 14 — Example of geoduck tubes in early stages of floral and faunal colonization within two months of installation. Log Item 1 Page 188 of 204 Smersh Farm Visual Assessment – Appendix B: Photos May 2018 Page 9 Photo 15 — Example of predator netting over geoducks. Note natural coloration and texture. Photo 16 — Example of geoduck tubes covered with predator netting. Note colonization by macroalgae (Ulvaria spp.) and natural coloration. Log Item 1 Page 189 of 204 Apr 03 2019 Log Item 1 Page 190 of 204 Log Item 1 Page 191 of 204 Log Item 1 Page 192 of 204 Log Item 1 Page 193 of 204 Log Item 1 Page 194 of 204 Apr 03 2019 Log Item 1 Page 195 of 204 Log Item 1 Page 196 of 204 Apr 03 2019Log Item 1 Page 197 of 204 Log Item 1 Page 198 of 204 Log Item 1 Page 199 of 204 Log Item 1 Page 200 of 204 Log Item 1 Page 201 of 204 Log Item 1 Page 202 of 204 Log Item 1 Page 203 of 204 Appellant Exhibit 54 page 1342 Apr 03 2019 Log Item 1 Page 204 of 204